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トランスオミクス解析によるがん細胞の放射線耐性応答ネットワーク解明

使用转组学分析阐明癌细胞的辐射抗性反应网络

基本信息

批准号：
22K07713
负责人：
金光祥臣
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Niigata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07713/
关键词：
放射線耐性細胞プロテオミクストランスオミクス iMPAQT

项目摘要

本研究は、樹立した放射線耐性細胞株及び経時的照射によって耐性能を進展させた段階的な親細胞株に対し、数万に及ぶ全タンパク質の絶対定量を可能にするプロテオミクス技術（iMPAQT 法）を中心とする定量トランスオミクスプラットフォームを適応し、がん細胞の放射線応答ネットワークの実体解明を目指している。また、このネットワークに対する介入実験により、がん細胞の放射線耐性能獲得における脆弱性を見つけ出し、分子メカニズムに基づく、バイオマーカーや創薬標的分子の創出を目的とする。今年度は、放射線応答の定量プロテオーム解析を行う予定であったが、研究代表者が所属する組織の業務再編や人事異動及びCOVID-19の影響などにより、予定した研究が全く進行できない状態が続いた。そのため、今年度は、研究方針を変更し、放射線耐性細胞の親水性メタボローム変動を詳細に把握するための新規LC-MS分析系の構築を行い、特殊な分析カラムを用いることでアミノ酸、有機酸、ATP、NAD類などの親水性（極性）の高い細胞内主要代謝物を網羅的かつ精密に一斉定量可能な分析系を構築できた。また、研究代表者が独自に開発した有機酸や脂肪酸などのカルボキシル基含有化合物の網羅的相対定量法を改良し、より短時間かつ高感度に検出できる分析系を構築した。さらに、iMPAQT 法を行うための、連結体人工遺伝子デザインや試薬類の準備及び測定手技を確立した。

This study aims to establish a new method for quantitative analysis of cell radiation resistance by establishing a radioresistant cell line and demonstrating the ability to develop radioresistant cell lines at different levels, such as in the tens of thousands and in the thousands, and in the absence of any quantitative analysis of cell radiation resistance by the MPAQT method. For example, if a cell is exposed to radiation, it may be vulnerable to radiation resistance. If a cell is exposed to radiation, it may be vulnerable to radiation. If a cell This year, the quantitative analysis of radiation response is scheduled to be carried out, and the business reorganization of the organization to which the research representative belongs, personnel changes and the impact of COVID-19 are scheduled to be carried out. This year, research policy changes, detailed understanding of the hydrophilicity of radio-resistant cells, construction of new LC-MS analytical systems, application of special analytical systems, construction of accurate quantitative analytical systems for the capture of major intracellular metabolites of high hydrophilicity (polarity) of acids, organic acids, ATP, and NAD. The representative researchers independently developed an analytical system for the determination of organic acids and fatty acids with high sensitivity in a short period of time by improving the relative quantitative method for the detection of compounds containing organic acids. In addition, iMPAQT method is used to prepare and determine the preparation and technology of linkage artificial gene test