メタゲノム解析とオミクス解析を用いたFontan術後蛋白漏出性胃腸症の病態解明

使用宏基因组分析和组学分析阐明 Fontan 手术后蛋白质丢失性胃肠病的病理学

• 批准号: 22K07912
• 负责人: 郷 清貴
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07912/
• 关键词: 蛋白漏出性胃腸症; 腸内細菌叢; Fontan手術; 単心室症; メタゲノム解析

Fontan術後に発症するPLEはしばしば治療抵抗性で予後不良であるが、発症や活動性を予測するバイオマーカーは開発されていない。本研究はFontan術後PLE患者とPLE未発症患者の腸内細菌叢を、16S rRNAを標的とした次世代シークエンスにより網羅的に解析して比較した。その上で細菌叢の多様性や特定菌種の存在量の変動がPLEの発症や活動性と関連するか検討することを目的とした。研究開始後、計17人のPLE患者とPLE未発症の対照患者23人の患者から同意を得た。PLE患者のうち1名、対照群のうち3名は細菌叢に影響しうる抗菌薬を内服中または検体不良によって除外した。PLE患者のうち活動性PLE患者が7名、1年以上血清アルブミン値: 3.0g/dl以上を維持している寛解期PLE患者が9名であった。対照群は20例となった。便サンプルから細菌DNAを抽出した後、16S rRNA領域のPCR増幅を行い、次世代シークエンンサーMiseqを用いて配列データを得た。配列データを得た後の細菌叢に関する一連の解析を、QIIME2パイプラインにより行った。細菌叢解析の結果、α多様性の指標であるShannon indexとChao1、Faith’s PDは、活動性PLE群で低く、細菌叢の多様性低下が示唆された。各群の細菌叢を主座標分析でプロットしunweghited Unifrac距離を算出すると、活動性PLEと対照群間および活動性PLEと寛解期 PLE間に差を認め、活動性PLE患者は他2群と異なる細菌叢を持つことが示唆された。今後は異なる手法での解析を追加し、成果について学会での報告、論文での発表を計画している。

Fontan postoperative に 発 disease す る PLE は し ば し ば treatment resistance after で to bad で あ る が, 発 や active を be す る バ イ オ マ ー カ ー は open 発 さ れ て い な い. This study は Fontan postoperative patients with PLE と PLE sufferer not 発 の intestinal bacterial flora を, 16 s rRNA を mark と し た nextgen シ ー ク エ ン ス に よ り snare に resolution し て compare し た. そ の で bacteria plexus の や specific strains の の the presence of many others in sex - move が PLE の 発 disease や active と masato even す る か beg す 検 る こ と を purpose と し た. After the start of the study, a total of 17 patients with <s:1> PLE, と patients without PLE, and 23 patients with <s:1> agreed that を obtained た. PLE patients の う ち 1, according to the group of seaborne の う ち three は bacterial flora に influence し う る antibacterial 薬 を internal and in ま た は 検 body bad に よ っ て except し た. PLE patients の う ち active が seven PLE patients, more than 1 year of serum ア ル ブ ミ ン nt: more than 3.0 g/dl を maintain し て い る understanding patients with stage solution PLE が nine で あ っ た. For the group of photos, there are となった 20 cases となった. Then サ ン プ ル か ら を bacterial DNA extraction し た, 16 s rRNA の PCR raised after painting line を い, next generation シ ー ク エ ン ン サ ー Miseq を with い て match column デ ー タ を た. After match column デ ー タ を have た の bacterial flora に masato す る for の analytical を, QIIME2 パ イ プ ラ イ ン に よ り line っ た. The results of bacterial colony analysis, α -polymorphism <s:1> index であるShannon indexとChao1, Faith 's PD, low activity PLE group で く, and low bacterial colony <s:1> polymorphism が indicate された. Each group of の bacterial flora を principal coordinates analysis で プ ロ ッ ト し unweghited を Unifrac distance calculated す る と, active PLE と polices according to group between お よ び active PLE と understanding solution phase に difference between PLE を め, active patients with PLE は his 2 group of と different な る bacterial flora を hold つ こ と が in stopping さ れ た. Future は different な る gimmick で の parsing を additional し, results に つ い て learn で の reports, papers で の 発 table を plan し て い る.

项目成果

Fontan術後蛋白漏出性胃腸症における16S rRNAシークエンスを用いた腸内細菌叢解析

使用 16S rRNA 测序分析 Fontan 手术后蛋白质丢失性胃肠病的肠道微生物群

• 发表时间: 2023
• 作者: Kiyotaka Go;Taiki Kojima;Fumio Watanabe;郷 清貴
• 通讯作者: 郷 清貴

Ultrasound-guided femoral vascular access in pediatric cardiac catheterization

超声引导下股骨血管通路在小儿心导管术中的应用

• DOI: 10.1111/ped.15446
• 发表时间: 2023
• 期刊: Pediatrics International
• 影响因子: 1.4
• 作者: Kiyotaka Go;Taiki Kojima;Fumio Watanabe
• 通讯作者: Fumio Watanabe

Effects of General Anesthesia on the Results of Cardiac Catheterization in Pediatric Patients with Ventricular Septal Defect

• DOI: 10.32604/chd.2023.027590
• 发表时间: 2023-01-01
• 期刊: CONGENITAL HEART DISEASE
• 影响因子: 0.3
• 作者: Go，Kiyotaka;Kato，Taichi;Yasuda，Kazushi
• 通讯作者: Yasuda，Kazushi