肺MAC症に関わる気道上皮細胞におけるエピジェネティック修飾の解析

肺 MAC 疾病中气道上皮细胞表观遗传修饰分析

• 批准号: 22K08249
• 负责人: 宮林 亜希子
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: 公益財団法人結核予防会 結核研究所
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08249/
• 关键词: エストロゲン; 気道上皮; エピジェネティック; 肺MAC症; 気道上皮細胞; エピジェネティック解析

非結核性抗酸菌症、特に肺のMycobacterium avium complex感染症 (肺MAC症) は近年わが国の結核罹患率を上回っており、また、多剤併用による２年以上の治療によっても難治で、環境中の弱毒菌である抗酸菌が感受性のある中高年女性に定着して慢性気道炎症を起こす宿主側の分子メカニズムの解明が求められている。本研究では、環境中の抗酸菌が、感受性のある中高年女性に定着して肺MAC症となる宿主側の分子メカニズムに、エピジェネティック修飾による遺伝子発現の変化が関わることを考え、肺MAC症患者群及び対照群より得られた気道上皮細胞 (手術検体) を材料としてゲノムワイドエピゲノム解析 (DNAメチル化解析) を行い、次世代シークエンサーを用いた網羅的遺伝子発現解析とあわせ、肺MAC症の背景にある気道粘膜の免疫・炎症応答性、粘膜防御能の脆弱性に関わる遺伝子を明らかにすることを目指す。本年度は、肺MAC症（症例）群、非慢性気道感染症（対照）群から各群4例の検体を選択し（全て女性、年齢マッチさせたもの）、我々が保有している手術検体から単離培養されたヒト初代培養気道上皮細胞から抽出したゲノムDNAを材料として、Illumina社Infinium MethylationEPIC BeadChipを使用したゲノムワイドDNAメチル化解析を行い、候補メチル化領域 differentially methylated regions (DMRs) の探索を行った。

Nontuberculous acidosis, に pulmonary Mycobacterium avium complex infection (pulmonary MAC disease) は recent わ の が countries suffering from tuberculosis rate を last っ て お り, ま た, tonic and に よ る 2 years の treatment に よ っ て も refractory で, weak environment の toadstool で あ る acid bacteria が susceptibility の あ る full female に fixed on し て chronic inflammation を 気 road, the こ す host side の molecular メ カ ニ ズ ム の interpret が o め ら れ て い る. This study で は, environment の acid bacteria が, sensibility の あ る full female に fixed on し て lung disease of MAC と な る host side の molecular メ カ ニ ズ ム に, エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク modified に よ る posthumous son 伝 発 の now - the が masato わ る こ と を え test, the group of patients with pulmonary disease of MAC and び according to group of seaborne よ り have ら れ た 気 way epithelial cells (surgery 検 body) を material と し て ゲ ノ ム ワ イ ド エ ピ ゲ ノ ム parsing (DNA メ チ ル resolve analysis) を い, next generation シ ー ク エ ン サ ー を with い た snare's son 伝 発 now parse と あ わ せ, lung MAC の background に あ る 気 の way mucosa immune inflammation 応 answer sex, mucosal defense can の vulnerability に masato わ る heritage 伝 son を Ming ら か に す る こ と を refers す. This year は MAC disease (cases), lung group, the chronic 気 adapting just-in-time inventory (as) seaborne group か ら each group of 4 cases of の 検 body を sentaku し (full て in women, 齢 マ ッ チ さ せ た も の), I 々 が retain し て い る surgery 検 か ら 単 from cultivating さ れ た ヒ ト original culture 気 way epithelial cell か ら spare し た ゲ ノ ム DNA を material と し て, Illumin Company a 's Infinium MethylationEPIC BeadChipを uses <s:1> たゲノムワ ド ドDNAメチ メチ to analyze を lines を and alternate メチ to ruralize differentially methylated regions (DMRs) <s:1> to explore を lines った.