肺MAC症に関わる気道上皮細胞におけるエピジェネティック修飾の解析

非結核性抗酸菌症、特に肺のMycobacterium avium complex感染症 (肺MAC症) は近年わが国の結核罹患率を上回っており、また、多剤併用による２年以上の治療によっても難治で、環境中の弱毒菌である抗酸菌が感受性のある中高年女性に定着して慢性気道炎症を起こす宿主側の分子メカニズムの解明が求められている。本研究では、環境中の抗酸菌が、感受性のある中高年女性に定着して肺MAC症となる宿主側の分子メカニズムに、エピジェネティック修飾による遺伝子発現の変化が関わることを考え、肺MAC症患者群及び対照群より得られた気道上皮細胞 (手術検体) を材料としてゲノムワイドエピゲノム解析 (DNAメチル化解析) を行い、次世代シークエンサーを用いた網羅的遺伝子発現解析とあわせ、肺MAC症の背景にある気道粘膜の免疫・炎症応答性、粘膜防御能の脆弱性に関わる遺伝子を明らかにすることを目指す。本年度は、肺MAC症（症例）群、非慢性気道感染症（対照）群から各群4例の検体を選択し（全て女性、年齢マッチさせたもの）、我々が保有している手術検体から単離培養されたヒト初代培養気道上皮細胞から抽出したゲノムDNAを材料として、Illumina社Infinium MethylationEPIC BeadChipを使用したゲノムワイドDNAメチル化解析を行い、候補メチル化領域 differentially methylated regions (DMRs) の探索を行った。

非結核性抗酸菌症、特に肺のMycobacterium avium complex感染症 (肺MAC症) は近年わが国の結核罹患率を上回っており、また、多剤併用による２年以上の治療によっても難治で、環境中の弱毒菌である抗酸菌が感受性のある中高年女性に定着して慢性気道炎症を起こす宿主側の分子メカニズムの解明が求められている。本研究では、環境中の抗酸菌が、感受性のある中高年女性に定着して肺MAC症となる宿主側の分子メカニズムに、エピジェネティック修飾による遺伝子発現の変化が関わることを考え、肺MAC症患者群及び対照群より得られた気道上皮細胞 (手術検体) を材料としてゲノムワイドエピゲノム解析 (DNAメチル化解析) を行い、次世代シークエンサーを用いた網羅的遺伝子発現解析とあわせ、肺MAC症の背景にある気道粘膜の免疫・炎症応答性、粘膜防御能の脆弱性に関わる遺伝子を明らかにすることを目指す。本年度は、肺MAC症（症例）群、非慢性気道感染症（対照）群から各群4例の検体を選択し（全て女性、年齢マッチさせたもの）、我々が保有している手術検体から単離培養されたヒト初代培養気道上皮細胞から抽出したゲノムDNAを材料として、Illumina社Infinium MethylationEPIC BeadChipを使用したゲノムワイドDNAメチル化解析を行い、候補メチル化領域 differentially methylated regions (DMRs) の探索を行った。