Development of an Efficient Screening Method for the Detection of Undiagnosed Primary Ciliary Dyskinesia.

开发一种有效的筛查方法来检测未确诊的原发性纤毛运动障碍。

• 批准号: 22K08297
• 负责人: 森本 耕三
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: 公益財団法人結核予防会 結核研究所
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08297/
• 关键词: 原発性線毛機能不全症候群

原発性線毛機能不全症候群 (PCD: primary ciliary dyskinesia) は運動性線毛の構造・機能に関わる遺伝子の病原性変異による遺伝性疾患で、臨床上、副鼻腔気管支症候群の特徴を呈する。我々はこれまで鼻腔一酸化窒素 (nNO) 濃度測定・線毛構造の電子顕微鏡検査 (EM)・ターゲットリシークエンスによる既知のPCD原因遺伝子のエクソン領域の変異解析を併せた診断体制を構築してきた。しかし、原因変異の同定ができない症例が少なからず存在するため、遺伝子エクソン領域のターゲットリシークエンスのみでは発見できない、大規模欠失や深部イントロン領域の病原性変異などを同定する方法の新規確立が緊喫の課題である。本研究ではスクリーニング・アルゴリズムを向上させ、鼻粘膜細胞の生検組織を用いた網羅的RNA発現解析（RNA-seq）を用いてスプライシング異常などを引き起こす新規原因遺伝子変異を検出する効率的な方法を開発し、さらに高精度のPCD原因遺伝子スクリーニング系の構築を目指す。今年度は、専用のキュレットで採取したEM検査用の鼻粘膜上皮生検検体から全RNAを抽出し、エクソン領域の配列をハイブリダイゼーションにより濃縮するtotal RNAライブラリー作成方法の条件検討を行ない、次世代シークエンサーを用いてシークエンスを行なった。最新のスプライシング異常検出ツールであるFRASERを用いてmRNA アイソフォームの遺伝的異常を明らかにすることができた。今後さらに解析検体を増やして原因となる変異の探索を進める。

Primary hair insufficiency syndrome (PCD: primary ciliary dyskinesia) kinesitic hair syndrome machine can be used to detect pathogenic hair syndrome, paranasal duct branch syndrome in bed and paranasal duct branch syndrome. We do not know that the cause of PCD is known to be caused by the determination of the concentration of acid asphyxiant (nNO) in the nasal cavity by measuring the concentration of acid asphyxiant (nNO) in the nasal cavity. The cause of the disease is the same as that of the disease. In the case of the disease, there is an increase in the number of patients in the field, the cause of the disease, the cause of the disease, the cause, the cause and the cause. The purpose of this study is to improve the accuracy of the RNA analysis (RNA-seq) of the nasal mucosal tissue. In this study, we use the RNA analysis of the Internet to analyze the causes of new regulations. In this study, we did a lot of work in this study. In this study, we did a lot of work in this study. In this study, we did a lot of work in this study. In this study, we used the RNA analysis of the nasal mucosa tissue and the analysis of the nasal mucosa tissue. This year, we used the nasal epithelium, the whole RNA, the whole RNA, the nasal epithelium, the whole RNA, the whole nasal epithelium, the whole nasal mucosa, the whole nasal epithelium, the whole nasal epithelium, the whole nasal mucosa, the whole nasal The latest news is that there is a lot of information about how to use the word "FRASER" to use the word "mRNA". In the future, we will analyze the cause of the disease and explore the cause of the disease.

项目成果

Analysis of aberrant splicing events and gene expression outliers in primary ciliary dyskinesia.

原发性纤毛运动障碍中异常剪接事件和基因表达异常值的分析。

• 发表时间: 2023
• 期刊: Am J Respir Cell Mol Biol
• 作者: Hijikata M;Morimoto K;Takekoshi D;Shimoda M;Wakabayashi K;Miyabayashi A;Guo TC;Yamada H;Keicho N.
• 通讯作者: Keicho N.