Exploring lineage determining factors for human megakaryocytes or erythroid differentiation in patients with JAK2 V617F by a novel fluctuation-based methodology

通过基于波动的新型方法探索 JAK2 V617F 患者中人类巨核细胞或红系分化的谱系决定因素

• 批准号: 22K08450
• 负责人: 永春 圭規
• 金额: $ 1.75万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08450/
• 关键词: 骨髄増殖性腫瘍; single cell RNA; MPN

Repository data[GSE156644]を用いてR(Seurat version3, CellChat)による、ヒト骨髄内の非血液細胞（CD45陰性細胞）を対象としたsingle cell RNA　sequencingによる2次および3次解析を行った。この結果から、骨髄線維症患者に特有の非血液細胞（骨髄ストローマ細胞）のレパートリーが線維症が進行するにつれて変化していくことを明らかにした。また、骨髄増殖性腫瘍患者に於いて特有の発現パターンを認める標的タンパク「A」を同定した。実臨床検体を用いて解析したところ　骨髄増殖性腫瘍患者に於いては正常患者あるいは骨髄不全患者と比較して、標的タンパク「A」の分布および発現量に変化を認めた。さらに実臨床検体として患者血清および、骨髄検体の検体について、標的タンパク「A」の発現レベルを解析している。今後は多重染色を用いて、非血液細胞の分布と標的タンパク「A」の分布について、空間的な関連性を検索していく。

Repository data[GSE156644] is used for R(Seurat version3, CellChat) and non-blood cells (CD45-negative cells) in bone marrow. As a result, non-blood cells (bone marrow cells) unique to patients with bone marrow disease are gradually developed. The patients with osteogenic tumors were identified as "A" in the middle of the disease. The distribution of A in patients with osteonecrosis is different from that in patients with normal osteonecrosis In addition, the clinical symptoms, serum levels, bone marrow symptoms, and the occurrence of "A" are analyzed. In the future, multiple staining, distribution of non-blood cells, distribution of "A" and spatial correlation will be investigated.