Exploring lineage determining factors for human megakaryocytes or erythroid differentiation in patients with JAK2 V617F by a novel fluctuation-based methodology
Exploring lineage determining factors for human megakaryocytes or erythroid differentiation in patients with JAK2 V617F by a novel fluctuation-based methodology
通过基于波动的新型方法探索 JAK2 V617F 患者中人类巨核细胞或红系分化的谱系决定因素
批准号：
22K08450
负责人：
永春 圭規
金额：
$1.75万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
项目状态：
未结题
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
翻译
Repository data[GSE156644]を用いてR(Seurat version3, CellChat)による、ヒト骨髄内の非血液細胞（CD45陰性細胞）を対象としたsingle cell RNA sequencingによる2次および3次解析を行った。この結果から、骨髄線維症患者に特有の非血液細胞（骨髄ストローマ細胞）のレパートリーが線維症が進行するにつれて変化していくことを明らかにした。また、骨髄増殖性腫瘍患者に於いて特有の発現パターンを認める標的タンパク「A」を同定した。実臨床検体を用いて解析したところ 骨髄増殖性腫瘍患者に於いては正常患者あるいは骨髄不全患者と比較して、標的タンパク「A」の分布および発現量に変化を認めた。さらに実臨床検体として患者血清および、骨髄検体の検体について、標的タンパク「A」の発現レベルを解析している。今後は多重染色を用いて、非血液細胞の分布と標的タンパク「A」の分布について、空間的な関連性を検索していく。
英文摘要
Repository data[GSE156644]を用いてR(Seurat version3, CellChat)による、ヒト骨髄内の非血液細胞（CD45陰性細胞）を対象としたsingle cell RNA sequencingによる2次および3次解析を行った。この結果から、骨髄線維症患者に特有の非血液細胞（骨髄ストローマ細胞）のレパートリーが線維症が進行するにつれて変化していくことを明らかにした。また、骨髄増殖性腫瘍患者に於いて特有の発現パターンを認める標的タンパク「A」を同定した。実臨床検体を用いて解析したところ 骨髄増殖性腫瘍患者に於いては正常患者あるいは骨髄不全患者と比較して、標的タンパク「A」の分布および発現量に変化を認めた。さらに実臨床検体として患者血清および、骨髄検体の検体について、標的タンパク「A」の発現レベルを解析している。今後は多重染色を用いて、非血液細胞の分布と標的タンパク「A」の分布について、空間的な関連性を検索していく。
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