AIによる前立腺癌病理情報に基づく遺伝子変異診断法の開発

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先行研究「前立腺癌遺伝子変異を予測する新規病理学的スクリーニング法の開発」では病理学的予後不良因子であるIntraductal carcinoma of the prostate (IDC-P)と前立腺癌遺伝子変異との相関関係を検討する研究の解析を行っている。ここではmHSPC（ホルモン未治療転移性前立腺癌）の前立腺生検標本をNGS（次世代シークエンサー）として遺伝子パネル検査により108遺伝子についての変異解析を行いこれらはすでに検査が終了しそのデータを取得してる。現在は病理学的検討結果と遺伝子変異結果の内容について解析段階にある。この解析が終了しだい、計画修正を行い前立腺生検HE標本の予備評価さらに固定不良例では標本再作成を行いバーチャルスライド化の準備を行うが、これら未染標本は先行研究ですでに作製完了済の状態にありバーチャルスライド化の準備はほぼ整った状況にある。ここから遺伝子変異解析結果および生検HE標本を理化学研究所AIP (革新知能総合研究センター)に送りスーパーコンピューターRAIDENを用いたAIによる教師無し学習により、癌の病理学的特徴と遺伝子異常の関連づけを本年度開始する予定である。最終的には転移性前立腺癌のHE標本から得られる病理情報を元に、AIにより前立腺癌組織中の遺伝子変異が予測可能な病理学的因子を導き出すことを目的としている。本研究により病理情報による補助診断で遺伝子変異が予測可能となり治療選択に繋げるのみならず、無効な遺伝子検査を回避することが実現可能となる。