新規触媒開発のためのリグニン特異的芳香環解裂酵素のアミノ酸配列の解析

木质素特异性芳环裂解酶氨基酸序列分析用于新型催化剂的开发

• 批准号: 08876032
• 负责人: 片山 義博
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Tokyo University of Agriculture and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08876032/
• 关键词: リグニン分解; 土壌微生物; sphingomonas paucimobilis; オキシゲナーゼ; 遺伝子構造; アミノ酸配列; リグニン芳香環解裂; リグニンビフェニル構造

本研究は、Sphingomonas paucimobilis SYK-6のリグニン芳香環解裂に関与するプロトカテク酸4,5-ジオキシゲナーゼと、リグニン・ビフェニル特異的環解裂酵素に着目して、類似した反応機構を持つが基質特異性の特異性の異なる2種類のリグニン特異的環解裂酵素のアミノ酸配列情報を明らかにして比較検討することで両酵素の基質特異性を決定している要因を探る事を目的として実施した。本研究の結果 リグニン・ビフェニル分解酵素(LigZ)が単一のポリペプチド鎖から構成される酵素であるのに対し、プロトカテク酸4、5-ジオキシゲナーゼ(LigA,B)は大小2このポリペプチド鎖で構成される酵素である事、また両酵素の基質特異性は共通性が低い事が明らかになった。さらに本研究では、リグニン・ビフェニル分解酵素(LigZ)のアミノ酸配列に類似した一次構造を有するタンパク質をコンピューターで検索した。高い類似性を示すタンパク質はデータバンクから見いだすことが出来なかったが、低い類似性を示す物としてプロトカテク酸4、5-ジオキシゲナーゼ(LigA,B)のLigBサブユニット(大サブユニット)が検索されてきた。両ポリペプチド鎖の類似性は21%であり、この結果から、リグニン・ビフェニル分解酵素(LigZ)の200番目から254番目のアミノ酸領域が、プロトカテク酸4、5-ジオキシゲナーゼ(LigA,B)のLigBサブユニット(大サブユニット)の147番目から195番目領域と類似性がかなり高い事が明らかになった。この領域が酵素反応機構の共通性を支える領域である可能性が高く、両者は進化的に保存された領域を持つことが明かとなった。

In this study, Sphingomonas paucimobilis SYK-6 のリグニン aromatic ring cleavage and するプロトカテク acid 4,5-ジオキシゲナーゼと,リグニン・ビフェニルSpecific cyclolytic enzymeにobjectして、Similar reaction mechanismをholdつがMatrix specificityのspecificityのisoなる2 kinds of のリグニンspecific cyclolytic enzyme のアミノacid alignment information を明らかにしてratio The substrate specificity of the enzyme is determined by the purpose and purpose of the enzyme. The results of this studyリグニン・ビフェニルcatalytic enzyme (LigZ)が単一のポリペプチドLOCKらConstitution of される enzyme であるのに対し, プロトカテク acid 4, 5-ジオキシゲナーゼ(LigA,B)は size 2このポリペプチドLOCKで constituted される enzymeである事、また両The substrate specificity of the enzyme and the commonality of the low い事が明らかになった.さらにThis study is based on では, リグニン・ビフェニルcatalytic enzyme (LigZ) のアミノ acid The arrangement is similar to the one-piece structure of the one-piece structure and the one-piece structure. High similarity and high similarityことが出なかったが、low いsimilarity をshowす物としてプロトカテクlic acid 4, 5-ジオキシゲナーゼ(LigA,B)のLigBサブユニット(大サブユニット)が検SOされてきた.両ポリペプチドLOCKのsimilarityは21%であり、このRESULTから、リグニン・ビフェニルDecomposing enzyme (LigZ) No. 200 No. 254 No. Acid field No. プロトカテクAcid 4, 5-ジオキシゲナーゼ(LigA,B)のLigBサブユニット(大サブユニット)の147th chapter から195th chapter field とsimilarity がかなり高い事が明らかになった. The commonality of the enzyme reaction mechanism in the field is the high possibility of the enzyme reaction mechanism, and the evolution of the field is the preservation of the field and the support of the field.