Ｆａｔｇｒａｐｈ　モデルを用いたタンパク質構造予測による抗菌薬開発手法の研究

基于Fatgraph模型蛋白质结构预测的抗菌药物开发方法研究

• 批准号: 13J11004
• 负责人: 根上 春
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-26 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J11004/
• 关键词: 概日リズム; 遅延を持つ微分方程式; メラトニン; 振動子の同期; 睡眠障害; 多体問題; 非線形力学; Fatgraph model; トポロジー; 構造生物学

生命活動における活性‐非活性状態の変化を数理モデル化し、そのリズムの安定化要因をシミュレーションを用いて明らかにすることで未知の制御システムへの示唆を得ることを目的とした。具体的には以下のように研究を行った。ヒトの覚醒ー睡眠の状態変化を研究の対象とした。更に、ヒトの睡眠を制御する体内の因子としてメラトニンホルモン、活動によって蓄積する疲労を取り、ヒトの睡眠を制御する体外の因子として日照を取り、それらの変化に依存して覚醒ー睡眠の状態が決定すると仮定して遅延を持つ微分方程式を用いた数理モデルを構築した。この数理モデルにおいて、それぞれ異なる周期で変化する内部因子と外部因子が同期して安定した睡眠周期を構築する条件を明らかにし、安定した睡眠周期獲得に必要な機構への示唆を得た。また、近年では時差を含む移動や夜間のシフトワークなどにより睡眠障害の患者が増加している傾向にあり、ヒトの睡眠リズムの制御機構を明らかにすることは重要な課題である。ヒトの睡眠周期は外部環境の変化に対してロバストであるが、個々の生体に固有の体内時計との連携システムの全体像は未知である。本研究においては数理モデルを用いてこの未知の機構を明らかにするための示唆を得るという意義がある。また、数学的には、遅延を持つ微分方程式が周期解を持つ条件を明らかにするという意義がある。

Life activities are active and inactive. Mathematical information and stabilization are necessary because of the use of information, and information. The following is a specific example of how to study the line. Wake up, sleep, sleep and sleep. In vivo sleep control, active sleep is used to control fatigue, sleep is used to control in vitro sleep, sleep is dependent on wakefulness, and the differential equation is used to determine the stability of sleep in vivo. In terms of mathematics, mathematics, sleep cycle, internal factors, external factors, diazepam, sleep cycle, sleep cycle and sleep cycle. In recent years, the time difference includes the movement of patients with sleep disorders during the night and the use of sleep warrants. in recent years, the time difference in recent years includes the movement of patients with sleep disorders at night. During the sleep cycle, the external environment is changed, and the internal time of each animal is linked to the whole image of the unknown animal. In this study, the mathematical and physical information is used to show that the unknown organization is clear that it means that the information is not available. The theory of mathematics, mathematics, and delay are based on the periodic solution of differential equations. The conditions are clear.