聴覚システムの適応進化：比較omics解析による責任遺伝子の探索と解析

听觉系统的适应性进化：通过比较组学分析搜索和分析负责基因

• 批准号: 26430181
• 负责人: 峯田 克彦
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26430181/
• 关键词: 聴覚; 進化; 多様性; 適応; 環境; ゲノム; omics

聴覚は、動物が外部環境を音として認識する感覚であり、コミュニケーションや外敵の察知などに機能する。特に哺乳動物は非常に高次で多様な聴覚機能を有することが知られており、その進化・適応メカニズムの解明は動物全体の進化・多様性を理解する上で不可欠な知見である。一方で、聴覚を担う機械受容システムは特定の責任遺伝子が明確でなく、システム自体の複雑さのために視覚などの 他の感覚器と比較して進化や多様性の研究は限られている。本研究では、哺乳類と鳥類からの-omicsデータの産出と情報学的、進化学的な比較解析に基づき、聴覚システムの適応的な機能獲得過程を明らかにしていくこと、さらに、その過程に深く関わる聴覚システムの責任遺伝子を明らかにすることを目的とした。これまでに、哺乳類のマウス、および鳥類のキンカチョウから内耳を単離し、RNA-seq解析に用いる複数のライブラリの構築準備が完了している。また、既存のデータベースより耳、および関連部位での遺伝子発現情報や疾患関連遺伝子等の調査・収集を行った。今後は、これらの材料、データを用いて、実験、および情報解析の両面からさらなる目的の達成に向けて研究を実施していく予定である。

The animal senses the environment and detects the enemy. Mammals in particular have very high diversity functions, so that knowledge, evolution, adaptation and understanding of the evolution, diversity of animals as a whole are not unknown. The research on the diversity of a mechanical system is limited by the definition of its own functional components and the comparison of its own functional components and other sensors. This study aims to clarify the process of functional acquisition of mammals and birds in the fields of informatics, comparative analysis, and genetic analysis, and to clarify the process of functional acquisition of birds and mammals in the fields of informatics and genetic analysis. As a result, the inner ears of mammals and birds are separated, and preparations for the construction of multiple colors for RNA-seq analysis are complete. The investigation and collection of information on the occurrence of diseases and related genes in the relevant parts of the body shall be carried out. In the future, we will carry out research on the application, implementation and analysis of materials and information.