Elucidation of human evolutionary process by induction of oogonia from ape iPS cells and their epigenomic analysis

通过猿 iPS 细胞诱导卵原细胞及其表观基因组分析来阐明人类进化过程

• 批准号: 21J15117
• 负责人: 藤原 浩平
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-28 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21J15117/
• 关键词: ヒト進化; 進化; 始原生殖細胞; エピゲノム; 類人猿; 霊長類; リピート

2022年度は、ヒト・チンパンジー・オランウータン・カニクイザルの多能性幹細胞 (PSC)、始原生殖細胞 (PGC) 様細胞 にそれぞれ特有、もしくは共通した発現パターンを示す遺伝子を同定し、霊長類進化に伴う遺伝子発現の変遷を明確に定義づけることができた。観察されたこれら遺伝子発現の変化は、別グループから近年発表されたヒト・カニクイザルin vivo PGCのデータに概して矛盾せず、培養系に起因する異質な変化ではなく本質的な種差を反映していることも確認できた。さらに、遺伝子発現の進化の原因究明を行った。一部の遺伝子は、類人猿特異的なリピート配列であるLTR5_Hsが少しずつゲノムに挿入されるに伴い発現が上昇しており、また別な遺伝子は、進化に伴う点突然変異により、PGC分化に重要な転写因子結合配列が生じ周囲にエンハンサーが出現したことで発現上昇しているように見える。以上のように、我々はPGC分化に伴う遺伝子発現とその背景にあるゲノム・エピゲノムの進化をこれまでにない解像度で定義づけることに成功し、現在は論文執筆の準備に取り掛かっている。

In 2022, the pluripotent stem cells (PSC) and primordial germ cells (PGC) of the Group were identified as unique, common, and common to all cell types, and the evolution of the long class was clearly defined. In recent years, we have observed that there are contradictions in the development of PGC in vivo, and the differences in the nature of PGC in culture systems are reflected in the differences in the nature of PGC. A study of the causes of the evolution of the gene and its development is being carried out. A part of the gene, ape-specific gene combination, LTR5_Hs, LTR5_Hs, LTR5 The above mentioned PGC differentiation is accompanied by the development of the gene, the background, the evolution of the gene, the definition of the resolution, the success, and the preparation of the paper.

项目成果

Evolution of the regulatory architecture for the specification of the human germ-cell lineage

人类生殖细胞谱系规范监管架构的演变

• 发表时间: 2023
• 作者: Kohei Fujiwara;Tomonori Nakamura;Keisuke Okita;Masanori Imamura;Taro Tsujimura;Yasuhiro Murakawa; Kazuhiro Takeuchi;Fumitaka Inoue;Hideya Kawaji;Michiel J.L. de Hoon;Hiroshi Mori;Masahiro Nagano;Shihori Yokobayashi;Guillaume Bourque;Mitinori
• 通讯作者: Mitinori