Comprehensive analysis of acidic patch binder using histone acylation catalysts
使用组蛋白酰化催化剂综合分析酸性贴片粘合剂
基本信息
- 批准号:22KJ1113
- 负责人:
- 金额:$ 1.6万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2023
- 资助国家:日本
- 起止时间:2023-03-08 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
エピゲノムはクロマチン結合タンパク質の動的な挙動により制御されている。中でも、クロマチンの主要な構成タンパク質であるヒストンのacidic patch領域は、多様なクロマチン結合タンパク質の足場であり、様々ながんにおいて突然変異が確認されるhotspotとしても知られている。しかしながら、生細胞内環境でacidic patch領域に結合するタンパク質(APB)を網羅的に解析する手法はこれまで存在しない。本計画ではAPBの網羅的検出のため、ヒストンアシル化化学触媒システムを用いることとした。化学触媒はリガンドによってヒストン上にリクルートされ、近傍のリジン残基を位置選択的にアシル化する。本計画では近傍タンパク質と光架橋を形成するプローブを含むアシル基を、化学触媒によってヒストンに導入するという戦略により、生細胞内でのAPB網羅的解析を目指した。本年度は、①アシル化触媒システムの改良および②ヒストンに導入したプローブとAPBの間での光架橋形成の初期検討を行った。①の触媒システムの改良については、化学触媒をヒストン上にリクルートするリガンドの設計を改変し、ヒストンへの結合能を向上させることで、より低い濃度でヒストンにアシル化を導入可能な化学触媒の開発に成功した。②に関しては、ヒストンに導入したプローブとacidic patch領域に結合するモデルタンパク質の間での光架橋形成についてin vitroでの初期検討を行い、細胞内での光架橋形成に向けた系の構築を行った。
The first step is to reduce the number of people who are in the middle of the game. The main components of the medium, the medium and the medium are the acidic patch of the medium, the medium and the medium are the hot spot, the medium and the medium are the hot spot and the medium is the acidic patch of the medium. There is no way to analyze the intracellular environment of living cells in combination with the substance (APB) This project aims to explore the potential applications of APB in chemical catalysts. Chemical catalysts are based on the position of the residue in the vicinity of the molecule. In this project, we aim to analyze APB net in living cells by introducing APB net into living cells, including APB group and chemical catalyst. This year, the initial stage of formation of photobridges between APB and APB was discussed. 1. The catalyst system was improved, and the chemical catalyst system was successfully developed by changing the design of the catalyst system and increasing the binding energy of the catalyst system at low concentration. (2) In the early stage of the study, the formation of photobridges in vitro and the construction of photobridges in cells are carried out.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ヒストンアシル化触媒システムの位置選択性制御と応用
组蛋白酰化催化剂体系的区域选择性调控及应用
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Dong Yu;Yang Ming-Min;Yoshii Mao;Matsuoka Satoshi;Kitamura Sota;Hasegawa Tatsuo;Ogawa Naoki;Morimoto Takahiro;Ideue Toshiya;Iwasa Yoshihiro;Dong Yu;Dong Yu;Dong Yu;野崎多実子
- 通讯作者:野崎多実子
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野崎 多実子其他文献
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