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中心体増加検知システムを介する細胞がん化抑制機構の解明

中心体增加检测系统介导的细胞癌抑制机制的阐明

基本信息

批准号：
22KJ0636
负责人：
竹田穣
金额：
$ 1.6万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ0636/
关键词：
中心体細胞分裂ストレス応答中心小体細胞骨格

项目摘要

1.注目因子ノックアウト細胞株の作製・表現型解析これまでに中心体増加を人為的に誘導したヒト由来培養細胞系でのゲノムワイドノックアウトスクリーニングにより、中心体増加に関与する重要因子の候補を複数得ていた。当該年度においては、候補因子のノックアウト細胞株の作製を昨年度から継続して行った。新たに複数因子のノックアウト細胞株の樹立に成功した。さらに、当該年度においては樹立済みの細胞株については野生型との比較による表現型解析を開始し、想定する中心体増加ストレス応答への関与を細胞生物学的に検証中である。既に複数のノックアウト細胞株でストレス応答の抑制等興味深い影響を捉えており、今後これらの因子の詳細な作用点が明らかになることが期待される。2.データベースを用いた情報学的手法による注目因子の特徴解析昨年度から行っているデータベースDepMapを用いた解析をより洗練し、多次元情報の次元削減によるマッピング比較等で注目因子間の関係性をより浮き彫りにした。昨年度実施した階層的クラスタリングによる分類と組み合わせて高精度の特徴解析が可能になっている。3.中心体増加ストレス応答解析系の開発・最適化中心体増加ストレス応答時に特異的に機能するタンパク質の活性を利用して、FRET効果によりストレス応答の有無を蛍光で検知する系を新たに開発した。現在、このセンサーの配列を改良することにより感度・特異性を最適化することを目指している。

1. The analysis of centrosome increase and phenotype of cell lines was induced artificially. The candidate of important factors related to centrosome increase and phenotype of cultured cell lines was obtained. During this year, the production of the candidate factor NIKOKATOT cell line began successfully last year. The new multiple factor was successfully established. In addition, when the year began, we established cell lines for comparison with wild-type phenotypes, and we determined whether centrosome development was related to cell biology. The inhibition of multiple cell lines is of great interest, and the detailed point of action of these factors is expected. 2. The characteristics of attention factors are analyzed by the method of informatics, and the relationship between attention factors is analyzed by the method of purification and dimensional reduction of multiple meta-information. The combination of classification and grouping in the implementation of hierarchical classification and classification makes high-precision feature analysis possible. 3. Development and optimization of centroid-enhanced response analysis system; development and optimization of centroid-enhanced response analysis system; development and optimization of centroid-enhanced response analysis system; development and optimization of centroid-enhanced response analysis system Now, the layout of the server is improved, the sensitivity and specificity are optimized, and the target is optimized.