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Discovery of glycan markers of pancreatic cancer stem cells by single-cell glycomics

通过单细胞糖组学发现胰腺癌干细胞的聚糖标记物

基本信息

批准号：
22K19471
负责人：
舘野浩章
金额：
$ 4.16万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19471/
关键词：
膵癌１細胞糖鎖糖鎖マーカー膵がん幹細胞１細胞解析

项目摘要

膵がんの５年生存率は未だ１０％未満であり、新たな治療診断技術の開発が世界中で切望されている。細胞の最表層に存在する糖鎖はがん化に伴い劇的に変化することから、新たな創薬標的として期待されている。申請者らは最近、個々の細胞に発現する糖鎖とRNAを同時解析する世界初の技術（scGR-seq）を開発した。本研究では、scGR-seqを用いて患者由来膵がん腫瘍組織を解析することで、腫瘍組織を構成する個々の細胞に発現する糖鎖発現とRNA発現情報を取得するとともに、がん幹細胞の新たな糖鎖マーカーを同定することを目的とする。本研究によって同定したがん幹細胞糖鎖マーカーは、膵がんの新たな創薬標的として医療応用を目指す。本年度はまずドロップレット技術をscGR-seqに導入することで、１万個の単一細胞を一斉解析する技術を構築した。そして膵癌細胞株と正常膵管細胞の解析を行い、得られたデータをフローサイトメトリーで得られたデータと比較検証した。その結果、scGR-seqで得られたデータは、フローサイトメトリーで得られた結果と高い相関を示すことがわかった。構築したドロップレット型scGR-seqを用いて膵癌オルガノイドの解析を行った。次世代シーケンス解析で得られたデータを用いて、現在データ解析中である。さらに膵癌患者検体からシングルセル化する方法を検討し、高い生存率で細胞を回収する技術を構築した。そして、得られた細胞を用いてscGR-seq解析を行った。

The 5-year survival rate of 赵がんの is not 10%, and the new therapeutic and diagnostic technology is expected to be developed in the world. The outermost layer of the cell has a sugar-locked sugar-locked sugar-locked sugar-locked sugar-locked sugar-locked sugar-locked sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar-coated sugar layer. The applicant has recently developed a world-first technology (scGR-seq) for simultaneous analysis of sugar locks and RNA in individual cells. In this study, scGR-seq was used to analyze the tumor tissue derived from the patient and analyze the individual cells that constitute the tumor tissue. The current information on the current sugar lock and RNA is obtained and the new sugar lock and stem cell stem cells are the same as the target. The purpose of this study is to identify the new target for medical use of stem cell sugar locks and new ones. This year, we introduced scGR-seq technology and constructed 10,000 cells per cell. Analyzes of urinary tract cancer cell lines and normal urinary duct cellsタをフローサイトメトリーでget られたデータと compare 検证した.そのRESULTS、scGR-seqで得られたデータは、フローサイトメトリーでGETられたRESULTSと高いrelatedをshowすことがわかった. Constructing the したドロップレット type scGR-seq and using the いて膵 Cancer オルガノイドのanalytical を行った. The next-generation シーケンス analysis is the られたデータを use いて, and the current データanalyst is the である. The method of transforming the body of patients with cancer and the high survival rate of cell recovery technology has been established.そして, られたcells were analyzed using いてscGR-seq.