蛍光バーコードを利用したインタラクトームイメージング法の開発

使用荧光条形码开发相互作用组成像方法

• 批准号: 22K19107
• 负责人: 樫田 啓
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19107/
• 关键词: 蛍光バーコード; 抗体; インタラクトーム; セリノール核酸

これまでに人工核酸の鎖交換反応を利用することで、蛍光色が”配列”に従って変化する蛍光バーコードの開発に成功している。本研究では、これを更に発展させることで生体分子間相互作用を可視化することを目指す。具体的には１）蛍光バーコードの拡張、及び２）それを利用した生体分子間相互作用解析について検討を行う予定である。本年度は１）の蛍光バーコードの拡張において重要となる人工核酸の鎖交換反応の速度論について重点的に解析を行った。具体的には我々が開発した人工核酸であるトレオニノール核酸（aTNA）及びセリノール核酸（SNA）のtoehold長を変化させ、系統的に鎖交換反応の速度を解析した。また、同様の配列をもつDNAとの比較を行った。その結果、人工核酸の鎖交換反応速度もDNA同様のtoehold長依存性を示すものの、低温においてはDNAと比較して反応が若干遅いことがわかった。これは人工核酸が高い二重鎖安定性を示すことに起因すると考えられる。一方、より高温条件下で同様の測定を行ったところ、人工核酸特にaTNAの鎖交換反応が大幅に高速化することが明らかとなった。このことは、aTNAを利用することで温度駆動型の論理回路を開発できることを示唆している。また、蛍光バーコードの蛍光色変化を高速化するためには室温より高温の温度が望ましいことがわかった。更に、aTNAのキラリティに応じて鎖交換反応の直交性を示すことが明らかとなった。これらの成果は現在論文投稿準備中である。

こ れ ま で に artificial nucleic acid の lock exchange the 応 を using す る こ と で 蛍 light color が "column" に 従 っ て variations change す る 蛍 light バ ー コ ー ド の open 発 に successful し て い る. This study で は, こ れ を more に 発 exhibition さ せ る こ と で raw body intermolecular interactions を visualization す る こ と を refers す. Specific に は 1) 蛍 light バ ー コ ー ド の company, zhang, and 2) び そ れ を using し た raw body intermolecular interactions parsing に つ い て 検 line for を う designated で あ る. は this year 1) の 蛍 light バ ー コ ー ド の company, zhang に お い て important と な る artificial nucleic acid の lock exchange the 応 の speed theory に つ い て key line of analytical を に っ た. Specific に は I 々 が open 発 し た artificial nucleic acid で あ る ト レ オ ニ ノ ー ル nucleic acid (aTNA) and び セ リ ノ ー ル nucleic acid (SNA) の toehold long を variations change さ せ exchange, system に lock anti 応 の speed を parsing し た. Youdaoplaceholder0, the same type of block is matched with を を DNAと <s:1> comparison を rows った. そ の results, artificial nucleic acid の lock anti 応 speed も exchange with others in DNA の toehold long dependence を shown す も の の, low temperature に お い て は と comparing DNA し て anti 応 が several 遅 い こ と が わ か っ た. <s:1> れ すると artificial nucleic acid が high <s:1> double locking stability を shows す す とに とに causes すると study えられる. Party, よ り で with others under high temperature is の measurement line を っ た と こ ろ, artificial nucleic acid に aTNA の lock exchange the 応 が high speed greatly に す る こ と が Ming ら か と な っ た. こ の こ と は, aTNA を using す る こ と で temperature 駆 moving type の logical loop を open 発 で き る こ と を in stopping し て い る. ま た 蛍 light バ ー コ ー ド の 蛍 high speed light color variations change を す る た め に は room-temperature よ り が at high temperature の temperature ま し い こ と が わ か っ た. Further に, aTNA に キラリティに応じて lock commutation anti応 <s:1> direct intersection を shows す とが とが indication ら となった となった となった となった. The results are currently being prepared for submission である.

项目成果

核酸の多様化を目指した人工核酸の開発

旨在实现核酸多样化的人工核酸的开发

• 发表时间: 2022
• 作者: Abe Satoshi;Tanaka Junko;Kojima Mariko;Kanamaru Shuji;Hirata Kunio;Yamashita Keitaro;Kobayashi Ayako;Ueno Takafumi;Kazuki Nakanishi;樫田啓
• 通讯作者: 樫田啓