权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

絶滅動物の進化ダイナミクス研究の革新的展開に向けた堆積物古代DNA解析法の確立

建立沉积物中古DNA分析方法，创新发展灭绝动物进化动力学研究

基本信息

批准号：
22K18730
负责人：
瀬川高弘
金额：
$ 4.16万
依托单位：
University of Yamanashi
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

日本列島にはかつて多様な中・大型の哺乳類が生息していたが，大型種の多くは更新世末（1.2万年前）までに絶滅し，その存在は化石でしか知ることができない．更新世の化石を用いた古代DNA研究は最近国内でもおこなわれるようになったが，それでも更新世化石の産出数は極めて少ないことから，絶滅動物の系統や渡来史などの全容解明には未だほど遠い．一方，近年では新たなアプローチとして年代の古い堆積物からの環境DNAが注目されている．しかし技術的難度の高さから国内では堆積物から更新世のDNAを解読した成功例がない．そこで本研究では更新世の大型哺乳類が産出している堆積物から古代環境DNA解析に挑戦した．堆積物試料の表面には現生の微生物群が多く付着しているため，それらのコンタミネーションを極力排除して古代DNA試料を採取し分析する必要がある．これまでクリーン環境下において試料内部のみを採取する手法を独自開発しており，これを用いて標本内部から試料を採取した．また更新世の堆積物中の大型動物のDNAの残存量は極めて少なく，断片化している．そのため代試料からの微量・短鎖DNAに特化した新たな抽出方法およびゲノムライブラリー構築を行うプロトコールの確立を図った．これまでに埼玉県の更新世の堆積物から環境DNAを抽出し，イルミナ社の次世代シークエンサーで塩基配列の取得をおこなった．現在，得られた塩基配列のデータから哺乳類DNA配列を抽出し，系統推定及び遺伝子の推定を行っている．また堆積物の採取時に大型動物の骨試料も採取され，現在その放射性炭素（14C）の量から年代を計測中である．

日本列克星敦人造石多晶中·大型人造乳生物信息原材料研究所，大型人造石多晶更新末期（1.2年前）的人造石研究所，以及现有人造石的已知生物信息研究所。更新化石化石利用人类古代DNA研究发现，最近国内出现了大量的基因突变，而且还发现更新化石化石的数量明显减少，化石物质系的数量减少，历史上曾有过一次全容性的灭绝。一方，本年度新的哺乳动物实验室研究了哺乳动物宿主菌年度内的哺乳动物宿主菌DNA序列登记研究。哺乳动物技术水平的高低决定了国内哺乳动物宿主菌更新的哺乳动物DNA解译成功的案例研究。生物材料表面生物微生物群众多，且多为耐高温采用胶体金本内部胶体金材料提取胶体金.胶体金更新胶体金材料中的大型胶体金DNA储存量胶体金微量提取，分步化胶体金提取.胶体金代胶体金材料提取微量·短链DNA特异化新方法提取胶体金，进行胶体金纳米颗粒的分离纯化，建立胶体金纳米颗粒的分离纯化方法。胶体金纳米颗粒的测定方法确保胶体金更新胶体金材料中的大型胶体金DNA提取，但这并不意味着他将成为一名出色的球员。在此，得将脱氧核糖核酸基配列后，将脱氧核糖核酸DNA配列提取出来，系泊推定及脱氧核糖核酸测定推行标准化。