微量検体の高効率RNA・DNA抽出及び解析前処理システム化に関する研究

微量样品高效RNA/DNA提取及分析预处理系统研究

• 批准号: 22K12880
• 负责人: 武居 修
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Research Institute for Clinical Oncology Saitama Cancer Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K12880/
• 关键词: RNA; DNA; 自動化; 装置開発; 抽出精製; 核酸

遺伝子検査解析は医療分野において様々に利用される。COVID-19感染症の感染症防疫の観点から、PCR検査が簡便、迅速正確な判定手法として一般に広く認知された。がん領域においてもがん遺伝子パネル検査などに広く用いられ、がんゲノム医療の知見も多数蓄積されている。近年、免疫チェックポイント阻害剤などが登場し、ゲノム変異のみならず、エピゲノム解析による奏効性予測の重要性が高まっているが、検体が微量で、解析までの処理が煩雑で、再現性が低く、未だ決定的奏効性マーカーが見いだされていない。遺伝子解析、エピゲノム解析では検体からの抽出精製、前処理が重要であり、我々はそれらをシステム化することを目指している。さらに上記解析に用いることができる、多様な検体からの高収率RNA・DNA抽出精製が可能な操作方法を確立し、バイサルファイト処理等の前処理システムを検討している。近年、RNA・DNA抽出精製には、磁性ビーズが用いられるが、培養液、緩衝溶液、希釈試料などでは、良好に抽出精製が可能であるが、唾液、咽頭液、喀痰、血液検体などの多くの夾雑物質、タンパク等を含む粘性を有する試料の場合にビーズ回収が困難となり、結果的に検出感度が低くなる場合が多い。一方でカラム法は遠心機を用いた操作が必要となり、システムが大型化し、処理に時間と手間を要する課題がある。我々は課題を解決すべく、カラム上部から加圧することで、多様な検体を遠心機を用いずに、簡便に処理するシステムを構築した。ゲノム解析への適用を鑑み、カラム上部からの試料圧送時の加圧速度や加圧時間等が収量等に影響する可能性があったため、モデルDNAを用い実施条件の検討、最適化を図った。今後、バイサルファイト処理等の条件検討等を実施する予定である。

The purpose of this paper is to analyze the division of medicine in the field of medicine. COVID-19 infection, infectious disease, epidemic prevention, PCR infection, rapid and correct diagnosis, general knowledge and knowledge. In the field of medicine, people in the field know that most of them are stored in the hospital. In recent years, the immune system has been used to prevent people from entering the arena, to tell the truth that the importance of sex is high, that the body is trace, that the reason is low, that the sex is low, and that it has not been decided. We need to analyze the essence of the body, the essence of the body, the important part of the system, and the key point of the system. It is possible to use the method of operation to make sure that the method of operation is accurate, such as the method of operation, such as the method of operation, the method of operation and so on. In recent years, RNA DNA extract semen, magnetic fluid, solution, hope and good extract may cause pain, saliva, pharynx, pharynx, sputum, blood, etc., which contain stickiness. The results showed that the sensitivity was low and the sensitivity was high. One party is responsible for monitoring the operation of the heart machine to make sure that it is necessary to carry out the necessary operation, to carry out the operation of large-scale equipment, and to manage the operation of the mobile phone. We will try to solve the problem, add the information in the upper part of the system, use the device in the multi-body heart machine, and make sure that you have the information to do so. In this paper, we analyze the impact of the parameters such as the evaluation of the use of equipment, the delivery time, the acceleration speed, the acceleration time, and so on, on the possibility of monitoring, the application of the DNA, the application of conditions, and the optimization of the system. From now on, you will need to know the conditions, such as the conditions, etc., and so on, and so on, and so on.