Development and application of hierarchical simulation system based on large-scale quantum chemical calculations
Development and application of hierarchical simulation system based on large-scale quantum chemical calculations
批准号:
22K12064
负责人:
西村 好史
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
大規模量子化学計算に基づく階層的シミュレーションシステムを構築し、ナノスケール分子集合体への応用を通して大規模モデルを用いたシミュレーションにおける量子的取り扱いの有効性の実証を目指す。階層的シミュレーションシステム構築のために、所属研究室で開発された大規模量子化学計算プログラムDCDFTBMDの高度化や補助ユーティリティ整備を行う。ナノスケール分子集合体への応用として、ナフィオン中のプロトン伝導や水溶性ポリマーの熱分解プロセスに対する化学反応シミュレーションの実行と解析を行う。2022年度は階層的シミュレーションシステムの構築に不可欠となる機能の追加をプログラムに施す。多数の分子種からなる系で進行する未知の反応性イベントのサンプリングを加速するナノリアクター分子動力学(NMD)法をDCDFTBMDプログラムに実装した。さらに、活性な分子種のみ加速効果が選択的に作用されるようNMD法のアルゴリズムを拡張した。これにより、従来のNMD法では困難であった溶液系における化学反応イベントの効果的なサンプリングが可能となった。DCDFTBMDと他の計算プログラムを接続するためのインターフェース開発を行い、合計5種類のプログラムとの接続を可能とした。これにより、量子化学計算と古典力場計算を組み合わせるハイブリッド計算や、より効果的な部分構造最適化およびポテンシャルエネルギー面探索、半古典動力学など幅広いシミュレーションについてDCDFTBMDを駆使した大規模量子化学計算手法の適用の見通しがたった。また、開発したインターフェースの応用事例として、従来数百原子以下の取り扱いがなされてきた水溶液系に対する核の量子効果を考慮したシミュレーションを数千原子規模の大規模モデルを用いて実行した。
英文摘要
大規模量子化学計算に基づく階層的シミュレーションシステムを構築し、ナノスケール分子集合体への応用を通して大規模モデルを用いたシミュレーションにおける量子的取り扱いの有効性の実証を目指す。階層的シミュレーションシステム構築のために、所属研究室で開発された大規模量子化学計算プログラムDCDFTBMDの高度化や補助ユーティリティ整備を行う。ナノスケール分子集合体への応用として、ナフィオン中のプロトン伝導や水溶性ポリマーの熱分解プロセスに対する化学反応シミュレーションの実行と解析を行う。2022年度は階層的シミュレーションシステムの構築に不可欠となる機能の追加をプログラムに施す。多数の分子種からなる系で進行する未知の反応性イベントのサンプリングを加速するナノリアクター分子動力学(NMD)法をDCDFTBMDプログラムに実装した。さらに、活性な分子種のみ加速効果が選択的に作用されるようNMD法のアルゴリズムを拡張した。これにより、従来のNMD法では困難であった溶液系における化学反応イベントの効果的なサンプリングが可能となった。DCDFTBMDと他の計算プログラムを接続するためのインターフェース開発を行い、合計5種類のプログラムとの接続を可能とした。これにより、量子化学計算と古典力場計算を組み合わせるハイブリッド計算や、より効果的な部分構造最適化およびポテンシャルエネルギー面探索、半古典動力学など幅広いシミュレーションについてDCDFTBMDを駆使した大規模量子化学計算手法の適用の見通しがたった。また、開発したインターフェースの応用事例として、従来数百原子以下の取り扱いがなされてきた水溶液系に対する核の量子効果を考慮したシミュレーションを数千原子規模の大規模モデルを用いて実行した。
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