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RoseTTAFold and AlphaFold modeling

RoseTTAFold 和 AlphaFold 建模

基本信息

批准号：
10527947
负责人：
VLADIMIR M YAROV-YAROVOY
金额：
$ 10万
依托单位：
UNIVERSITY OF CALIFORNIA AT DAVIS
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
2021
资助国家：
美国
起止时间：
2021-12-01 至 2023-06-30
项目状态：
已结题

来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/10527947
关键词：
Administrative Supplement Complement Computer Analysis Modeling Molecular Conformation Running System TRPV1 gene in silico protein structure prediction

项目摘要

Project summary This administrative supplement is to obtain a necessary system for computational analysis. Recent advancements in in silico protein structure prediction as demonstrated by the AlphaFold and RosettaFold offer promising opportunities to straighten the ongoing project. We aim to materialize these opportunities with this administrative suppoement.

项目摘要这一行政补充是为了获得一个必要的系统进行计算分析。通过AlphaFold证明的计算机蛋白质结构预测的最新进展和RosettaFold为理顺正在进行的项目提供了有希望的机会。我们的目标是通过这种行政支持来实现这些机会。

项目成果

期刊论文数量（11）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Structural mechanisms underlying activation of TRPV1 channels by pungent compounds in gingers.

生姜中的刺激性化合物激活 TRPV1 通道的结构机制。

DOI：
10.1111/bph.14766
发表时间：
2019
期刊：
British journal of pharmacology
影响因子：
7.3
作者：
Yin,Yue;Dong,Yawen;Vu,Simon;Yang,Fan;Yarov-Yarovoy,Vladimir;Tian,Yuhua;Zheng,Jie
通讯作者：
Zheng,Jie

The capsaicin binding affinity of wildtype and mutant TRPV1 ion channels.

DOI：
10.1016/j.jbc.2023.105268
发表时间：
2023-11
期刊：
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子：
4.8
作者：
Li, Shisheng;Zheng, Jie
通讯作者：
Zheng, Jie

De Novo Design of Peptidic Positive Allosteric Modulators Targeting TRPV1 with Analgesic Effects.

具有镇痛作用的靶向 TRPV1 的肽正变构调节剂的从头设计

DOI：
10.1002/advs.202101716
发表时间：
2021-09
期刊：
Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
影响因子：
0
作者：
Xu L;Zhang H;Wang Y;Lu X;Zhao Z;Ma C;Yang S;Yarov-Yarovoy V;Tian Y;Zheng J;Yang F
通讯作者：
Yang F

An Unorthodox Mechanism Underlying Voltage Sensitivity of TRPV1 Ion Channel.

DOI：
10.1002/advs.202000575
发表时间：
2020-10
期刊：
Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
影响因子：
0
作者：
Yang F;Xu L;Lee BH;Xiao X;Yarov-Yarovoy V;Zheng J
通讯作者：
Zheng J

A Non-covalent Ligand Reveals Biased Agonism of the TRPA1 Ion Channel.

DOI：
10.1016/j.neuron.2020.10.014
发表时间：
2021-01-20
期刊：
Neuron
影响因子：
16.2
作者：
Liu C;Reese R;Vu S;Rougé L;Shields SD;Kakiuchi-Kiyota S;Chen H;Johnson K;Shi YP;Chernov-Rogan T;Greiner DMZ;Kohli PB;Hackos D;Brillantes B;Tam C;Li T;Wang J;Safina B;Magnuson S;Volgraf M;Payandeh J;Zheng J;Rohou A;Chen J
通讯作者：
Chen J