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PROCESS - Proteomics data Collection, Software and Standards to support open access and long term management of data

PROCESS - 蛋白质组学数据收集、软件和标准，支持数据的开放获取和长期管理

基本信息

批准号：
BB/K020145/1
负责人：
Henning Hermjakob
金额：
$ 36.29万
依托单位：
European Bioinformatics Institute
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2013
资助国家：
英国
起止时间：
2013 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FK020145%2F1
关键词：
PROCESS Proteomics data Collection Software

项目摘要

Abstracts are not currently available in GtR for all funded research. This is normally because the abstract was not required at the time of proposal submission, but may be because it included sensitive information such as personal details.

目前GtR中并没有所有资助研究的摘要。这通常是因为在提交提案时不需要摘要，但也可能是因为摘要中包含个人详细信息等敏感信息。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Recognizing millions of consistently unidentified spectra across hundreds of shotgun proteomics datasets.

DOI：
10.1038/nmeth.3902
发表时间：
2016-08
期刊：
Nature methods
影响因子：
48
作者：
Griss J;Perez-Riverol Y;Lewis S;Tabb DL;Dianes JA;Del-Toro N;Rurik M;Walzer MW;Kohlbacher O;Hermjakob H;Wang R;Vizcaíno JA
通讯作者：
Vizcaíno JA

Identifying novel biomarkers through data mining-a realistic scenario?

DOI：
10.1002/prca.201400107
发表时间：
2015-04
期刊：
Proteomics. Clinical applications
影响因子：
0
作者：
Griss J;Perez-Riverol Y;Hermjakob H;Vizcaíno JA
通讯作者：
Vizcaíno JA

A Golden Age for Working with Public Proteomics Data.

DOI：
10.1016/j.tibs.2017.01.001
发表时间：
2017-05
期刊：
Trends in biochemical sciences
影响因子：
13.8
作者：
Martens L;Vizcaíno JA
通讯作者：
Vizcaíno JA

Accurate estimation of isoelectric point of protein and peptide based on amino acid sequences.

DOI：
10.1093/bioinformatics/btv674
发表时间：
2016-03-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
0
作者：
Audain E;Ramos Y;Hermjakob H;Flower DR;Perez-Riverol Y
通讯作者：
Perez-Riverol Y

On best practices in the development of bioinformatics software.

DOI：
10.3389/fgene.2014.00199
发表时间：
2014
期刊：
Frontiers in genetics
影响因子：
3.7
作者：
Leprevost Fda V;Barbosa VC;Francisco EL;Perez-Riverol Y;Carvalho PC
通讯作者：
Carvalho PC

DOI：
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发表时间：
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期刊：
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影响因子：
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作者：
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通讯作者：
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数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
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作者：
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作者：
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数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
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数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

Henning Hermjakob其他文献

Minimum information about a bioactive entity (MIABE)

生物活性实体的最小信息（MIABE）

DOI：
10.1038/nrd3503
发表时间：
2011-08-31
期刊：
NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY
影响因子：
101.800
作者：
Sandra Orchard;Bissan Al-Lazikani;Steve Bryant;Dominic Clark;Elizabeth Calder;Ian Dix;Ola Engkvist;Mark Forster;Anna Gaulton;Michael Gilson;Robert Glen;Martin Grigorov;Kim Hammond-Kosack;Lee Harland;Andrew Hopkins;Christopher Larminie;Nick Lynch;Romeena K. Mann;Peter Murray-Rust;Elena Lo Piparo;Christopher Southan;Christoph Steinbeck;David Wishart;Henning Hermjakob;John Overington;Janet Thornton
通讯作者：
Janet Thornton

Reactome - Pathway Context and Visualisation for Omics Data

DOI：
10.1016/j.bpj.2018.11.1784
发表时间：
2019-02-15
期刊：
Conference abstract
影响因子：
作者：
Henning Hermjakob
通讯作者：
Henning Hermjakob

An informatic pipeline for the data capture and submission of quantitative proteomic data using iTRAQ TM

DOI：
10.1186/1477-5956-5-4
发表时间：
2007-02-01
期刊：
Proteome Science
影响因子：
1.600
作者：
Jennifer A Siepen;Neil Swainston;Andrew R Jones;Sarah R Hart;Henning Hermjakob;Philip Jones;Simon J Hubbard
通讯作者：
Simon J Hubbard

DAS Writeback: A Collaborative Annotation System

DOI：
10.1186/1471-2105-12-143
发表时间：
2011-05-10
期刊：
BMC BIOINFORMATICS
影响因子：
3.300
作者：
Gustavo A Salazar;Rafael C Jimenez;Alexander Garcia;Henning Hermjakob;Nicola Mulder;Edwin Blake
通讯作者：
Edwin Blake

Broadening the horizon – level 2.5 of the HUPO-PSI format for molecular interactions

DOI：
10.1186/1741-7007-5-44
发表时间：
2007-10-09
期刊：
BMC BIOLOGY
影响因子：
4.500
作者：
Samuel Kerrien;Sandra Orchard;Luisa Montecchi-Palazzi;Bruno Aranda;Antony F Quinn;Nisha Vinod;Gary D Bader;Ioannis Xenarios;Jérôme Wojcik;David Sherman;Mike Tyers;John J Salama;Susan Moore;Arnaud Ceol;Andrew Chatr-aryamontri;Matthias Oesterheld;Volker Stümpflen;Lukasz Salwinski;Jason Nerothin;Ethan Cerami;Michael E Cusick;Marc Vidal;Michael Gilson;John Armstrong;Peter Woollard;Christopher Hogue;David Eisenberg;Gianni Cesareni;Rolf Apweiler;Henning Hermjakob
通讯作者：
Henning Hermjakob