Exploring the spatiotemporal functioning and regulation of RNA Polymerases in the live Escherichia coli bacterium
探索活大肠杆菌中 RNA 聚合酶的时空功能和调节
基本信息
- 批准号:2446099
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:英国
- 项目类别:Studentship
- 财政年份:2020
- 资助国家:英国
- 起止时间:2020 至 无数据
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Of the centrally dogmatic processes relating DNA to RNA to protein, transcription is the key step in which DNA is utilised to produce a complementary read in the form of RNA, enacted by RNA polymerases (RNAPs). Within the most prominent prokaryotic model, Escherichia coli, the spatiotemporal dynamics of transcription - i.e. the rate at which RNA is transcribed from DNA, exact localisations in the central mass of DNA (nucleoid) and in discrete DNA regions (plasmids) - have become increasingly studied with the advent of single-molecule, single-cell technologies such as superresolution microscopy. This project brings a two-pronged approach in developing and refining live cell tools utilising the specificity of DNA/RNA fluorescent probes and genetic engineering of DNA constructs to further refine existing techniques, and aims to apply these tools alongside superresolution microscopy to study the spatiotemporal regulation of RNAP in the contexts of RNAP subunit exchange in response to environmental stimuli and in the intrinsic supercoiling states of the nucleoid. Studying both the dynamics of the nucleoid via supercoiling-based regulation and RNAP enzymatic structural variations via sigma factor exchange in detail, in tandem with a broader observation of RNAP population distribution across the live cell at any one time via PALM superresolution microscopy will provide a more holistic appreciation for the multifactorial means of transcriptional regulation in the cell, underpinning the complexity, and indeed necessity of understanding, of basic science.
在DNA、RNA和蛋白质之间的中心教条过程中,转录是关键的一步,在这一过程中,DNA被用来产生由RNA聚合酶(RNAP)调控的RNA形式的互补读数。在最著名的原核生物模型--大肠杆菌中,随着超分辨显微镜等单分子、单细胞技术的出现,转录的时空动力学--即从DNA转录RNA的速度,DNA中心质量(类核)和离散DNA区域(质粒)的准确定位--已经得到越来越多的研究。该项目采用了一种双管齐下的方法来开发和提炼活细胞工具,利用DNA/RNA荧光探针的特异性和DNA结构的基因工程来进一步改进现有的技术,并旨在将这些工具与超分辨率显微镜一起应用于研究RNAP亚单位交换对环境刺激的响应和在类核的内在超螺旋状态下RNAP的时空调节。通过超螺旋调控的类核动态和通过Sigma因子交换的RNAP酶结构变化的详细研究,结合通过Palm超分辨率显微镜对RNAP群体在任何时候在活细胞中的分布的更广泛的观察,将提供对细胞中转录调控的多因素手段的更全面的认识,从而支持基础科学的复杂性和理解的必要性。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
其他文献
Internet-administered, low-intensity cognitive behavioral therapy for parents of children treated for cancer: A feasibility trial (ENGAGE).
针对癌症儿童父母的互联网管理、低强度认知行为疗法:可行性试验 (ENGAGE)。
- DOI:
10.1002/cam4.5377 - 发表时间:
2023-03 - 期刊:
- 影响因子:4
- 作者:
- 通讯作者:
Differences in child and adolescent exposure to unhealthy food and beverage advertising on television in a self-regulatory environment.
在自我监管的环境中,儿童和青少年在电视上接触不健康食品和饮料广告的情况存在差异。
- DOI:
10.1186/s12889-023-15027-w - 发表时间:
2023-03-23 - 期刊:
- 影响因子:4.5
- 作者:
- 通讯作者:
The association between rheumatoid arthritis and reduced estimated cardiorespiratory fitness is mediated by physical symptoms and negative emotions: a cross-sectional study.
类风湿性关节炎与估计心肺健康降低之间的关联是由身体症状和负面情绪介导的:一项横断面研究。
- DOI:
10.1007/s10067-023-06584-x - 发表时间:
2023-07 - 期刊:
- 影响因子:3.4
- 作者:
- 通讯作者:
ElasticBLAST: accelerating sequence search via cloud computing.
ElasticBLAST:通过云计算加速序列搜索。
- DOI:
10.1186/s12859-023-05245-9 - 发表时间:
2023-03-26 - 期刊:
- 影响因子:3
- 作者:
- 通讯作者:
Amplified EQCM-D detection of extracellular vesicles using 2D gold nanostructured arrays fabricated by block copolymer self-assembly.
使用通过嵌段共聚物自组装制造的 2D 金纳米结构阵列放大 EQCM-D 检测细胞外囊泡。
- DOI:
10.1039/d2nh00424k - 发表时间:
2023-03-27 - 期刊:
- 影响因子:9.7
- 作者:
- 通讯作者:
的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('', 18)}}的其他基金
An implantable biosensor microsystem for real-time measurement of circulating biomarkers
用于实时测量循环生物标志物的植入式生物传感器微系统
- 批准号:
2901954 - 财政年份:2028
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Exploiting the polysaccharide breakdown capacity of the human gut microbiome to develop environmentally sustainable dishwashing solutions
利用人类肠道微生物群的多糖分解能力来开发环境可持续的洗碗解决方案
- 批准号:
2896097 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
A Robot that Swims Through Granular Materials
可以在颗粒材料中游动的机器人
- 批准号:
2780268 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Likelihood and impact of severe space weather events on the resilience of nuclear power and safeguards monitoring.
严重空间天气事件对核电和保障监督的恢复力的可能性和影响。
- 批准号:
2908918 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Proton, alpha and gamma irradiation assisted stress corrosion cracking: understanding the fuel-stainless steel interface
质子、α 和 γ 辐照辅助应力腐蚀开裂:了解燃料-不锈钢界面
- 批准号:
2908693 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Field Assisted Sintering of Nuclear Fuel Simulants
核燃料模拟物的现场辅助烧结
- 批准号:
2908917 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Assessment of new fatigue capable titanium alloys for aerospace applications
评估用于航空航天应用的新型抗疲劳钛合金
- 批准号:
2879438 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Developing a 3D printed skin model using a Dextran - Collagen hydrogel to analyse the cellular and epigenetic effects of interleukin-17 inhibitors in
使用右旋糖酐-胶原蛋白水凝胶开发 3D 打印皮肤模型,以分析白细胞介素 17 抑制剂的细胞和表观遗传效应
- 批准号:
2890513 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
Understanding the interplay between the gut microbiome, behavior and urbanisation in wild birds
了解野生鸟类肠道微生物组、行为和城市化之间的相互作用
- 批准号:
2876993 - 财政年份:2027
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Studentship
相似国自然基金
基于分子动力学的沥青/集料界面行为Spatiotemporal模型
- 批准号:51378073
- 批准年份:2013
- 资助金额:72.0 万元
- 项目类别:面上项目
多维动态时空耦合映象分析及其应用研究
- 批准号:60571066
- 批准年份:2005
- 资助金额:21.0 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Interrogating the Potential of Ccn1+ Astrocyte Niches to Drive Angiogenesis after Spinal Cord Injury
探讨 Ccn1 星形胶质细胞生态位在脊髓损伤后驱动血管生成的潜力
- 批准号:
10607960 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Significance of Protein Synthesis by the Integrated Stress Response in Neuromodulatory Neurons for Adaptive Behavior and Synaptic Plasticity
神经调节神经元综合应激反应蛋白质合成对适应性行为和突触可塑性的意义
- 批准号:
10718345 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Impact of Trauma on the Longitudinal Development of Cognitive Control Networks in Healthy Youth
创伤对健康青少年认知控制网络纵向发展的影响
- 批准号:
10752294 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Spatiotemporal alterations of thalamocortical circuitry functioning underlie pain
丘脑皮质回路功能的时空变化是疼痛的根源
- 批准号:
10659569 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Intrinsic control of early microglia development and its impact on neural cell development
早期小胶质细胞发育的内在控制及其对神经细胞发育的影响
- 批准号:
10739972 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Integrative spinal physiology to restore neural control of sensorimotor functions after neurological injury
综合脊柱生理学恢复神经损伤后感觉运动功能的神经控制
- 批准号:
10829116 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Elucidating the Genetic Etiology of Intellectual Disability in African, Asian, and European Families
阐明非洲、亚洲和欧洲家庭智力障碍的遗传病因
- 批准号:
10660541 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Interrogating neurogenic defects in complex assembloid models of fragile X syndrome
探讨脆性 X 综合征复杂组合体模型中的神经源性缺陷
- 批准号:
10727933 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
A national study on the effects of air pollution and temperature on children's neurodevelopmental outcomes
一项关于空气污染和温度对儿童神经发育结果影响的全国研究
- 批准号:
10585592 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别: