RADx-Rad Discoveries & Data: Consortium Coordination Center Program Organization

点击翻译按钮获取中文摘要

ABSTRACT     Preparing SARS-­CoV-­2 testing data for reuse requires making the data syntactically and semantically equivalent.  Standardization  of  terminologies  and  a  common  data  model  accomplish  the  former,  while  the  latter  is  accomplished  through  understanding  the  data  and  making  it  comparable  across  RADx-­rad  awardees  by  benchmarking against known gold standards. The standardization of samples is as important as standardizing  the data, particularly in the highly innovative RADx-­rad program, where new technologies will be developed or  optimized for deployment in various settings. Highly motivated RADx-­rad awardees will receive advice on how  their diagnostics compare to FDA-­approved ones, with each other, how their diagnostic performs in independent  testing,  as  well as how  to ensure  the  tests  are usable  in  real  world  settings.  In  collaboration  with  University  of  Texas  Health  Science  Center  at  Houston,  University  of  California San  Diego  researchers  in  informatics/data  science and infectious diseases with ample experience in leading large consortia have designed a unique RADx-­ rad  Consortium  Data  and  Coordination  Center  (radCDCC).  This  center  is  based  on  three  pillars:  (1)  effective  administration and coordination among awardees, NIH, and other programs;; (2) innovative approaches and tools  to  collect  and  standardize  data  and  metadata  to  promote  findability,  accessibility,  interoperability  and  reuse  (FAIR)  for  data  sharing;;  and  (3)  principled  preparation  of  standardized  samples  with  known  quantities  of  viral  loads, and standardized procedures for testing new diagnostics to allow comparison across tests and calibration  of  new  technologies.  Backed  by  sophisticated  HIPAA-­compliant  cloud  services,  user  friendly  web-­tools,  and  extensive  support  from  UCSD’s  facilities  for  computation and  for  clinical  research,  the  radCDCC will  interface  with other RADx programs and other COVID-­19 focused programs at NIH to ensure alignment of awardees, NIH  and the public in the pursuit of effective, affordable, and deployable new technologies for testing.