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The role of SMARCA1 in Rhabdomyosarcoma and Skeletal Muscle Differentiation

The role of SMARCA1 in Rhabdomyosarcoma and Skeletal Muscle Differentiation
SMARCA1 在横纹肌肉瘤和骨骼肌分化中的作用
批准号：
10926538
负责人：
Marielle Yohe
金额：
$22.1万
依托单位：
DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
--
资助国家：
美国
项目状态：
未结题
起止时间：
至
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/10926538
关键词：
ATAC-seqAlveolarApoptosisCRISPR/Cas technologyCTNNB1 geneCell Differentiation processCell ProliferationCellsChIP-seqChildhood Soft Tissue SarcomaChromatinChromatin Remodeling FactorChromosomal translocationClassificationCollaborationsFGFR4 geneFOXO1A geneGenesGrowthHDAC2 geneHistologicISWIKnock-outMethodsMuscleMutationMyoblastsOncogenesPAX3 genePAX7 genePIK3CA genePhenotypeProcessProliferatingProtein FamilyProtein IsoformsProteinsRhabdomyosarcomaRoleSMARCA1 geneSkeletal MuscleSwitching ComplexSystemTP53 geneTissuesTumor Suppressor Proteinscancer typechromatin remodelingexperimental studymyogenesisskeletal muscle differentiationtargeted cancer therapytranscriptome sequencingtumor progressiontumorigenesistumorigenic

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
SMARCA 1在RMS组织中高度表达，但在肌肉组织中不表达。此外，我们发现SMARCA 1与HDAC 2在横纹肌肉瘤细胞中相互作用。SMARCA 1表达在肌源性分化过程中增加。CRISPR/Cas9用于敲除RH 30细胞中的SMARCA 1表达。我们正在制造SMARCA 1 KO RD细胞。我们将使用ATAC-seq来研究SMARCA 1 KO导致的染色质可及性的变化。此外，我们将检查SMARCA 1 KO对这些PAX融合阳性（RH 30）和阴性（RD）细胞分化的表型影响。该项目是与朱迪·戴维斯合作。
英文摘要
SMARCA1 is expressed highly in RMS tissues but not in muscle tissues. In addition, we show that SMARCA1 interacts with HDAC2 in rhabdomyosarcoma cells. SMARCA1 expression increases during myogenic differentiation. CRISPR/Cas9 was used to knock out SMARCA1 expression in RH30 cells. We are in the process of making SMARCA1 KO RD cells. We will use ATAC-seq to investigate changes in chromatin accessibility as a result of SMARCA1 KO. In addition, we will examine the phenotypic impact of SMARCA1 KO on the differentiation of these PAX-fusion positive (RH30) and negative (RD) cells. The project is in collaboration with Judy Davie.
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会议论文
Dual Blockade of IGF1R and MEK synergistically inhibits pediatric cancers
  • 批准号：
    10486986
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $74.11万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    Marielle Yohe
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
Targeting RAS in Pediatric Cancer
  • 批准号：
    10487040
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $22.23万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    Marielle Yohe
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
Regulation of differentiation and invasion in RMS by ASAP1
  • 批准号：
    10702796
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $41.49万
  • 财政年份：
    --
  • 负责人：
    Marielle Yohe
  • 依托单位：
    DIVISION OF BASIC SCIENCES - NCI
Advancing RAS and RASopathy Therapies
海外基金