Atlas phylogéographique des conifères du Canada - A phylogeographical atlas of canadian conifers

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La phylogéographie vise notamment à déterminer la répartition géographique des lignées ancestrales intraspécifiques. De telles cartes devraient constituer un outil essentiel pour orienter les efforts de conservation des espèces arborescentes au plan de leurs ressources génétiques. Ce projet de génomique a pour but de jeter les bases d'un atlas phylogéographique des arbres du Canada. La priorité portera sur la cartographie géographique de la diversité du génome mitochondrial des conifères à distribution transcontinentale et de ceux couvrant le centre et l'est du Canada. Puisque le génome mitochondrial est transmis maternellement chez la plupart des conifères, il est représentatif du seul flux génique par semences et son niveau de structuration géographique est beaucoup plus élevé que celui du génome nucléaire ou chloroplastique. À l'aide de marqueurs de l'ADN mitochondrial, nous avons pu récemment identifier les grandes lignées ancestrales géographiquement distinctes chez l'épinette noire (Picea mariana) et le pin gris (Pinus banksiana), deux conifères à large distribution. Le projet exploitera ces preuves de concept afin d'identifier les lignées ancestrales de 8 conifères et leur répartition géographique. Les cartes phylogéographiques obtenues permettront d'estimer les voies de migration post-glaciaire, de délimiter des unités évolutivement distinctes ainsi que d'identifier les zones de suture entre lignées, zones susceptibles de renfermer le maximum de diversité génétique. Il en découlera la définition de nouveaux indicateurs pour la conservation de la diversité génétique. L'atlas phylogéographique servira d'élément de base catalyseur d'un atlas génécologique inter-disciplinaire au fur et à mesure que deviendront disponible d'autres cartes émanant de la méta-analyse de tests génécologiques, de marqueurs génétiques spécifiquement liés à l'adaptation ou encore, de données de répartition des microsymbiotes ou des pathogènes associés aux différentes espèces forestières. Ce projet contribuera à raffermir la place du Canada parmi les leaders mondiaux du développement d'outils génomiques visant le diagnostic à grande échelle de la biodiversité, en lien avec ses engagements internationaux au niveau de la conservation de la biodiversité.