L' épigénome : les options d'un génotype en réponse aux changements environnementaux

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La plasticité phénotypique permet aux individus de faire face aux fluctuations environnementales et de survivre dans différents environnements. Les mécanismes qui génèrent cette flexibilité tels les processus épigénétiques, sont cependant peu connus. Les poissons Chrosomus eos-neogaeus sont des hybrides asexués et représentent un modèle idéal pour l'étude de ces phénomènes. Dans les lacs de l'est du Québec, les individus ne présentent pas de différence génétique mais sont retrouvés dans une grande diversité d'environnements et révèlent une grande variabilité phénotypique. Les objectifs de ce proposé sont de préciser comment les variations épigénétiques se produisent sur le génome, comment elles affectent le phénotype et la valeur adaptative et comment l'environnement influence ces mécanismes. Afin de répondre à ces objectifs, nous utiliserons les technologies du séquencage de prochaine génération afin de déterminer les patrons épigénétiques et les niveaux d'expression des gènes au sein d'une lignée clonale. Cette approche sera par la suite appliquée à différentes lignées d'hybrides retrouvés au Canada afin de comparer leur variation épigénétique et leur valeur adaptative. Ces résultats permettront de corréler génotypes, épigénotypes, phénotypes et environnements. La réalisation de ce programme de recherche permettra une avancée majeure dans la compréhension des facteurs régissant la variation du phénotype. Ces connaissances permettront non seulement d'avoir une vision élargie du potentiel évolutif des populations naturelles, mais pourront également s'appliquer autant aux programmes d'amélioration des animaux d'élevage qu'au domaine de la santé humaine.