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Prediction of interactions involving intrinsically disordered proteins

预测涉及本质无序蛋白质的相互作用

基本信息

批准号：
RGPIN-2015-05412
负责人：
Gsponer, Joerg
金额：
$ 2.55万
依托单位：
University of British Columbia
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Discovery Grants Program - Individual
财政年份：
2017
资助国家：
加拿大
起止时间：
2017-01-01 至 2018-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=632526
关键词：
Prediction interactions involving intrinsically disordered

项目摘要

Intrinsically disordered (ID) proteins play a central role in protein interactomes because their ID segments often mediate large numbers of interactions. We have shown previously that interactions mediated by ID protein segments are characterized by features that distinguish them from other protein interactions. We hypothesize that these features can be used to (i) identify interaction sites on globular proteins that preferentially bind ID proteins and (ii) determine the structures that ID protein segments adopt upon binding. Based on this hypothesis, we propose the following aims:

蛋白质内部无序（ID）蛋白质在蛋白质相互作用组中起着核心作用，因为它们的ID片段通常介导大量的相互作用。我们以前已经表明，由ID蛋白片段介导的相互作用的特征在于将它们与其他蛋白质相互作用区分开来。我们假设这些特征可用于（i）鉴定优先结合ID蛋白的球状蛋白上的相互作用位点，以及（ii）确定ID蛋白片段在结合时采用的结构。基于这一假设，我们提出以下目标：

项目成果

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Gsponer, Joerg其他文献

Protein synthesis rate is the predominant regulator of protein expression during differentiation

DOI：
10.1038/msb.2013.47
发表时间：
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Kristensen, Anders R.;Gsponer, Joerg;Foster, Leonard J.
通讯作者：
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Analysis of Sub-τc and Supra-τc Motions in Protein Gβ1 Using Molecular Dynamics Simulations

DOI：
10.1016/j.bpj.2009.07.061
发表时间：
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期刊：
BIOPHYSICAL JOURNAL
影响因子：
3.4
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Bui, Jennifer M.;Gsponer, Joerg;Dobson, Christopher M.
通讯作者：
Dobson, Christopher M.

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DOI：
10.1021/ja0752080
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2008-07-16
期刊：
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Dhulesia, Anne;Gsponer, Joerg;Vendruscolo, Michele
通讯作者：
Vendruscolo, Michele

Identification of aggregation-prone elements by using interaction-energy matrices

DOI：
10.1002/anie.200802345
发表时间：
2008-01-01
期刊：
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子：
16.6
作者：
Bui, Jennifer M.;Cavalli, Andrea;Gsponer, Joerg
通讯作者：
Gsponer, Joerg

A coupled equilibrium shift mechanism in calmodulin-mediated signal transduction.

DOI：
10.1016/j.str.2008.02.017
发表时间：
2008-05
期刊：
STRUCTURE
影响因子：
5.7
作者：
Gsponer, Joerg;Christodoulou, John;Cavalli, Andrea;Bui, Jennifer M.;Richter, Barbara;Dobson, Christopher M.;Vendruscolo, Michele
通讯作者：
Vendruscolo, Michele