Développement d'une méthode de détection rapide des effets bénéfiques de l'interaction des plantes avec des rhizobactéries (PGPR) par l'intermédiaire de gènes indicateurs.

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Certaines bactéries naturellement présentent dans le sol interagissent avec les racines des plantes et les aident àpuiser/acquérir leurs nutriments, favorisant ainsi leur croissance. L'entreprise Biotechnologies Ulyssedéveloppe, entre autre, des consortiums bactériens favorisant la santé et la croissance des plantes et permettantainsi de réduire les besoins en engrais chimiques et en pesticides des cultures, ce qui diminue les coûts deproduction et la pollution associée à l'extraction et au lessivage des fertilisants. Pour créer/mettre au point cesproduits, il est nécessaire de tester des centaines de bactéries différentes, mais l'effet sur la croissance desplantes n'est souvent mesurable qu'après plusieurs semaines de culture (environ 90 jours pour la tomate parexemple). Biotechnologies Ulysse utilise donc la lentille d'eau, une petite plante aquatique dont la croissanceest très rapide, pour effectuer ses essais préliminaires. De cette façon, il est possible d'obtenir des résultats en10 jours environ. Pour faciliter la recherche des meilleures souches, il serait souhaitable d'obtenir des résultatsencore plus rapidement. Notre projet a donc comme objectif de développer une méthode de criblage par PCRquantitatif produisant des résultats en 2 jours ou moins. Cette méthode se base sur un ensemble de gènesindicateurs de la réponse des plantes à la biostimulation pouvant être mesurés aussi bien dans la lentille d'eauque dans les cultures cibles. Ces gènes seront identifiés par comparaison du transcriptome de la lentille d'eaucultivée en condition de biostimulation ou non.