酸性矿山废水(AMD)污染是全球性的环境问题之一。但酸性矿山废水导致河流生态系统退化的机理尚不清楚。底栖动物是了解河流生态系统结构和功能以及健康状况的关键类群，对于维持河流生态系统的平衡具有重要作用。本项目在研究思路上突破以往研究中偏重河流结构属性的传统思维，以底栖动物群落为研究对象，通过清洁河流与受AMD污染河流的比较，研究底栖动物参与河流生态系统的生产、消费和分解三个生态过程中的异同，从河流生态系统功能属性受损的角度来"诊断"AMD对河流生态系统健康的影响。阐明AMD导致河流生态系统功能退化的机理是否与次级生产力低下、食物网结构中某些重要环节缺失以及凋落物分解过程中缺乏某些底栖动物功能摄食群等因素有关，并研究AMD对河床生物膜、底栖动物漂流模式及其纵向分布格局的影响等问题。以揭示AMD导致河流生态系统退化的内在机理，为热带亚热带地区受AMD污染的河流的生态修复和治理提供对策和理论依据。