首先用理化方法对已选定的3个试验站位的污染物（重金属、PAHs、氮、磷、）进行4个季节时空动态变化检测分析，证明污染物随着站位与时间变化较大，在夏秋两季较高，在春季和冬季稍低，时空变化总趋势还是李村河入海口污染最重，属重度污染；海泊河入海口属中度污染；石老人近海污染最轻，属轻度污染。.采用DGGE指纹图谱技术对上述典型污染海域半知菌多样性时空变化与生境的关系进行研究，首次发现在这些污染海域半知菌普遍存在，并与污染程度不同形成明显的对应关系。半知菌数量和种类在轻度与中度污染范围内，随着污染的加重而增加，在重度污染海域，污染物的增加将导致半知菌数量和种类下降。结合传统的分离培养技术对半知菌群体结构的调查，证明半知菌群体以青霉属Penicillium为绝对优势种类。.选出的2株青霉指示菌株（Penicillium griseofulvum，Penicillium oxalicm）对污染物尤其是重金属变化反应敏感，其形态和色素对污染的程度具有较好的指示作用，通过ITS 序列差异及特殊酶基因（Isoamyl Alcohol Oxidase，IAO）设计了2个特异性强的基因探针，利用套式 PCR检测靶标真菌的灵敏度可达10 fg/μL，比传统测试方法提高了103倍，并成功完成污染海域的检测。.经课题资助在国内外学术期刊发表文章11篇，其中SCI收录刊物6篇，申请国家发明专利2项，培养研究生5人，超额完成计划书的任务指标