基于NanoDESI-LTQ-FT质谱和小分子化合物网络快速鉴定微生物来源的抗结核活性成分
批准号:
81302678
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
23.0 万元
负责人:
张敬宇
依托单位:
学科分类:
微生物药物
结题年份:
2016
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
何文妮、刘苗苗、黄佩、张雨菡
中文摘要
结核病是威胁人类健康的世界三大传染病之一,多药耐药结核(MDR-TB)和广泛耐药结核(XDR-TB)的不断出现使结核病再次回归公众视线。天然产物是抗结核药物研发的重要来源,其中来自于微生物的天然产物是其重要组成部分。我们在本实验室已经建立的来自于多种生态环境(深海、高原土壤、盐湖、火山以及中药内生菌)、高生物多样性的天然菌株库基础上,采用NanoDESI-LTQ-FT技术和MS/MS networking (二级质谱小分子网络),结合计算机统计分析技术,建立次级代谢产物小分子网络库,把不同结构类型的化合物列于不同的网络簇上,依此进行快速排重和鉴定新的活性化合物。NanoDESI技术简化了天然产物排重的繁琐步骤,而计算机科学协助我们无需数据库,直接高效进行海量数据的分析和归类。本课题中这一平台的建立和进一步完善,对快速发现和定位新结构的活性天然产物具有重要意义。
英文摘要
Tuberculosis (TB) is one of the world's three major infectious diseases that threaten human health, the continuous emergence of multi-drug resistant tuberculosis (MDR-TB) and extensively drug-resistant tuberculosis (XDR-TB) leads TB once again to be an important topic of global public health. Natural products are an important source of anti-TB drugs, part of which are from microbial sources. Hence, we intend to apply nanoDESI mass spectrometry, MS/MS networking and computer statistics analysis technology to analyze the secondary metabolites directly from the agar plates. The molecular networking generated based on MS2 pattern of secondary metablites will be used for the rapid de-replication of natural products.NanoDESI can simplify the procedures of de-replication, while computer science can directly analyze and classify the mass data without database. This proposal will develop a new approach for de-replication and rapid identification of active compounds from microbe, which is the most critical issue in the natural products drug discovery field.
结核病是威胁人类健康的世界三大传染病之一,多药耐药结核(MDR-TB)和广泛耐药结核(XDR-TB)的不断出现使结核病再次回归公众视线。天然产物是抗结核药物研发的重要来源,其中来自于微生物的天然产物是其重要组成部分。我们在本实验室已经建立的来自于多种生态环境(深海、高原土壤、盐湖、火山以及中药内生菌)、高生物多样性的天然菌株库基础上,采用NanoDESI-LTQ-FT技术和MS/MS networking (二级质谱小分子网络),结合计算机统计分析技术,建立次级代谢产物小分子网络库,把不同结构类型的化合物列于不同的网络簇上,依此进行快速排重和鉴定新的活性化合物。NanoDESI技术简化了天然产物排重的繁琐步骤,而计算机科学协助我们无需数据库,直接高效进行海量数据的分析和归类。基于此平台,共分离鉴定16个化合物,包含4个新化合物和1个新天然产物,化合物1-3具有很好的体外细胞毒活性,化合物13和14具有很好的体外抗MRSA活性,化合物2, 4, 10具有较好的体外抗BCG活性。本课题中这一平台的建立和进一步完善,对快速发现和定位新结构的活性天然产物具有重要意义。
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Discovery of tashinone derivatives with anti-MRSA activity via targeted bio-transformation
通过靶向生物转化发现具有抗 MRSA 活性的塔西酮衍生物
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
Synthetic and Systems Biotechnology
影响因子:
4.8
作者:
[Tanja Grkovic, Luo Houwei, Zhang Lixin, Liu Xueting]
通讯作者:
Liu Xueting
Structure revision of the Penicillium alkaloids haenamindole and citreoindole
青霉生物碱 haenamindole 和 citreinondole 的结构修正
DOI:
10.1016/j.tetlet.2016.07.049
发表时间:
2016-08-24
期刊:
TETRAHEDRON LETTERS
影响因子:
1.8
作者:
[Song, Fuhang, He, Hongtao, Capon, Robert J.]
通讯作者:
Capon, Robert J.
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
Virulence
影响因子:
5.2
作者:
[Ren, Biao, Tong, Yaojun, Dai, Huanqin, Zhang, Lixin, ]
通讯作者:
Fungal biotransformation of tanshinone results in [4+2] cycloaddition with sorbicillinol: evidence for enzyme catalysis and increased antibacterial activity
丹参酮的真菌生物转化导致[4 2]与山梨西林醇的环加成:酶催化和抗菌活性增加的证据
DOI:
10.1007/s00253-016-7488-6
发表时间:
2016-10-01
期刊:
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
影响因子:
5
作者:
[He, Wenni, Liu, Miaomiao, Liu, Xueting]
通讯作者:
Liu, Xueting
Noncyanogenic Cyanoglucoside Cyclooxygenase Inhibitors from Simmondsia chinensis
来自西蒙得木的非氰基氰基葡萄糖苷环加氧酶抑制剂
DOI:
10.1021/acs.orglett.6b00206
发表时间:
2016-04-15
期刊:
ORGANIC LETTERS
影响因子:
5.2
作者:
[Abdel-Mageed, Wael M., Bayoumi, Soad A. L., Liu, Xueting]
通讯作者:
Liu, Xueting
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