课题基金 / 基金详情

马鸡属鸟类的物种分化模式研究

批准号:
31272296
项目类别:
面上项目
资助金额:
88.0 万元
负责人:
张正旺
依托单位:
学科分类:
动物进化与发育
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
董路、王宁、阙品甲、谷浪屿、朱叮叮

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
物种形成(Speciation)是进化生物学研究的核心问题之一。马鸡属(Crossoptilon)是我国鸟类的一个特有属,包含四种马鸡,即白马鸡(Crossoptilon crossoptilon)、藏马鸡(Crossoptilon harmani)、蓝马鸡(Crossoptilon auritum)和褐马鸡(Crossoptilon mantchuricum),由于它们分布区少有重叠且生态环境有差异,是研究物种分化的理想对象。本项目拟利用新一代转录组测序技术,结合生物信息学方法、ABC近似贝氏计算统计等方法,查明四种马鸡的分化时间与基因流程度,探讨地理隔离和生态压力在促进物种形成中的相对重要性;在此基础上筛选与马鸡分化有关的功能基因,并尝试对与之相关的表型进行定量分析,初步确定基因型-表型相关关系。
英文摘要
Speciation is one of the core issues in evolutionary biology. Crossoptilon is endemic to China, including White Eared Pheasant (Crossoptilon crossoptilon), Tibetan Eared Pheasant (Crossoptilon harmani), Blue Eared Pheasant (Crossoptilon auritum) and Brown Eared Pheasant (Crossoptilon mantchuricum). Considering they have little overlap of the distribution and live in different ecological environment, these four species are the ideal species for studying species divergence. This project will use the new generation of transcriptome sequencing technology, combining with bioinformatics methods, Approximate Bayesian Computation (ABC) method and other statistical methods, investigate the divergent time and gene flow suspend time of the four species, explore the relative importance of geographical isolation and ecological pressures in the divergence; Screening functiion genes involved in species divergence and try to quantitative analysis of the associated phenotype, build the genotype-phenotype relationship finally.
本课题针对物种形成( Speciation)这个进化生物学的核心问题,以我国鸟类的特有属马鸡属( Crossoptilon)及其相关物种为对象开展了深入研究。马鸡属包含四种马鸡,即白马鸡( Crossoptilon crossoptilon)、藏马鸡( Crossoptilon harmani)、蓝马鸡( Crossoptilon auritum)和褐马鸡( Crossoptilon mantchuricum) ,本项目利用新一代转录组测序技术,结合基因组测序、 ABC 近似贝氏计算统计等方法,查明了四种马鸡的分化时间与基因流程度,探讨了地理隔离和生态压力在促进物种形成中的相对重要性;在此基础上筛选了与马鸡分化有关的功能基因,初步确定了基因型-表型的相关关系。基于四种马鸡476个血液差异表达基因重构的系统发育树,y研究结果支持“褐马鸡与蓝马鸡亲缘关系比较近,藏马鸡和白马鸡亲缘关系比较近”的观点;差异表达基因分析显示,相对于其他三种马鸡而言,藏马鸡是一个非常特殊的物种。而且在藏马鸡中,与高海拔环境相适应的基因和与疾病相关的基因显著上调。利用相似的研究方法,我们对山鹧鸪的物种分化和分类问题进行了探讨,重新确立了树鹧鸪属的分类地位,检验了白眉山鹧鸪广西亚种的有效性并提出该亚种应作为一个独立的保护单元。在此基础上,我们对包括马鸡属在内的鸡形目鸟类的分化时间和地理起源问题进行了探讨, 检验了现有的物种分布是由地理阻隔还是长距离迁徙的作用。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Revival of the genus Tropicoperdix Blyth 1859 (Phasianidae, Aves) using multilocus sequence data
使用多位点序列数据复兴 Tropicoperdix Blyth 1859(雉科,鸟纲)
DOI: 10.1111/zoj.12273
发表时间: 2015-10-01
期刊: ZOOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY
影响因子: 2.8
作者: [Chen, De, Liu, Yang, Zhang, Zhengwang]
通讯作者: Zhang, Zhengwang
DOI: 10.1007/s10336-013-0989-5
发表时间: 2013
期刊: Journal of Ornithology
影响因子: 1.3
作者: [Jianqiang Li;Yingying Liu;Yong Wang;Zhengwang Zhang]
通讯作者: Jianqiang Li;Yingying Liu;Yong Wang;Zhengwang Zhang
DOI: 10.1016/j.ympev.2012.12.013
发表时间: 2013-04-01
期刊: MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION
影响因子: 4.1
作者: [Gu, Langyu, Liu, Yang, Zhang, Zhengwang]
通讯作者: Zhang, Zhengwang
Do Parents and Helpers Discriminate between Related and Unrelated Nestlings in the Cooperative Breeding Silver‐Throated Tit ?
银喉山雀合作繁殖中,父母和帮手是否会区分有亲缘关系和无亲缘关系的雏鸟?
DOI: --
发表时间: 2014
期刊: Ethology
影响因子: 1.7
作者: [J Li, Z Zhang, L Lv, C Gao, Y Wang]
通讯作者: Y Wang
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    东亚—澳大利西亚迁飞区黑尾塍鹬迁徙路线与遗传分化研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      55万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      张正旺
    • 依托单位:
    基于种群基因组的褐马鸡遗传多样性格局及其影响因素研究
    • 批准号:
      31872244
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      62.0万元
    • 批准年份:
      2018
    • 负责人:
      张正旺
    • 依托单位:
    人为扰动对渤海湾水鸟栖息地利用和繁殖成功率的影响研究
    • 批准号:
      31572288
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      67.0万元
    • 批准年份:
      2015
    • 负责人:
      张正旺
    • 依托单位:
    栖息地片段化条件下褐马鸡种群遗传结构研究
    • 批准号:
      30770314
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      35.0万元
    • 批准年份:
      2007
    • 负责人:
      张正旺
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金