选择具代表性或在系统排列中具关键地位的藓类植物标本作为材料，通过对孢子体进行石蜡切片，显微镜下观察和分析各植物孢子体的结构和特征，综合考虑配子体，传胞类型，生态环境等因素，辅以分子生物学证据，将具有相同或相异孢子体特征的藓类不同类群的系统关系进行重组和归类, 然后确定各大类藓类植物之间的系统演化及亲缘关系。根据藓类植物的传孢结构为特征指定演化程度，以传孢器官结构分为五个类型，包括腐媒传孢型（包括原生藓亚纲）、风媒传孢型、汽风媒传孢型、虫媒传孢型和水媒传孢型的基础上，将藓类植物共分为6个亚纲，包括原生亚纲Protobryoidae，泥炭藓亚纲Sphagnidae，黑藓亚纲Andreaeidae, 金发藓亚纲Polytrichiidae, 顶蒴藓类亚纲Acrocarpoiidae, 和侧蒴藓类亚纲Pleurocarpoidae。提出苔藓植物门中最简单结构是其中的原生藓亚纲，其仅有原始苔藓的特征，简单的配子体和孢子体，仅适于湿土生，短命，孢蒴腐解散放孢子。该类群包括夭命藓科，团口藓科，Protobryaceae C. Gao, Y.H. Wu et W. Li fam. nov., 无轴藓科, 长台藓科, 大孢藓科, Hymenostomaceae C. Gao, Y.H. Wu et W. Li fam. nov., 侧球藓科共8科。其中被修订过的团口藓科中增加了之前被置于丛藓科的矮藓属，细丛藓属，Phascopsis，和Phascum4个属。新建的原生藓科包括之前被置于葫芦藓科的小蒴藓属，Goniomitrium, Micropoma, 小立碗藓属, 拟葫芦藓属，牛毛藓科的高地藓属Astomiopsis, Cladastomum, 并列藓属, Eobruchea，曲尾藓科的小烛藓属, 大孢藓科的Costesia，細叶蘚科的Stylostegium，丛藓科的艳枝藓属，以及新建的原生藓属。苔纲是由藓纲演化而来，其相接类群是黑藓亚纲的藻藓目(Takakiale)和蒴帽苔亚纲的裸蒴苔目(Haplomitriale)。对某些疑难类群如藻藓目、水藓目、壶藓目等的归属作出调整，最终排列一以属为单位的新藓类系统表，并提出初步的苔藓植物起源和进化路线，以期更接近藓类植物的自然演化过程。