课题基金基金详情
TIRAP基因标签SNP的筛选及其与汉族人群急性肺损伤易感性的关联研究
结题报告
批准号:
81000023
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
20.0 万元
负责人:
宋振举
依托单位:
学科分类:
H0109.急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
褚迅、王传军、邵勉、沈珉、尹俊、杨达伟、毕晶、王洵
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中文摘要
基因变异与急性肺损伤(ALI)的易感性相关。Toll样受体(TLRs)信号传导通路参与炎症介质生成的调控,通路的过渡激活介导了体内炎症介质的过量生成,启动了ALI的发病。我们近期利用Hapmap数据库选择标签SNPs进行研究,发现编码TLRs信号通路关键衔接蛋白的TIRAP基因2个SNPs(其中1个位于3'UTR)与ALI易感性显著相关,但具体机制不明;目前Hapmap数据库尚不完善,需进一步深度测序探寻是否有其它重要功能SNPs存在。本课题拟首先对TIRAP基因5'UTR、启动子、外显子和3'UTR区域进行测序,筛查标签SNPs并在研究样本中进行分型,探寻是否存在其它的与ALI发病相关的功能SNP;然后利用体内外功能研究方法探讨前期发现的位于3'UTR的SNP是否具有调节基因表达的功能,并对研究中可能发现的其它SNPs进行功能验证。本研究将系统阐述TIRAP基因变异与ALI易感的相关性。
英文摘要
完善ALI/ARDS标本库建设,共收集健康对照910例、ICU疾病对照822例和ALI/ARDS患者465例的血液标本和临床信息。采用PCR直接测序的方法对TIRAP基因6个外显子、启动子、5’UTR和3’UTR区域进行测序。发现位于TIRAP基因启动子区域的1个SNP (A/G)与前期研究的rs595209高度连锁。基因分型研究提示该SNP与ALI/ARDS的易感性相关; ALI/ARDS患者携带等位基因A频率明显高于ICU对照和健康对照组。为阐明其影响ALI/ARDS的发病机制,我们进行了功能研究。分离健康志愿者的外周血PBMCs并进行培养,给予LPS刺激后提取PBMCs的RNA和分离细胞培养上清液;测定携带不同基因型的个体TIRAP mRNA和细胞培养上清液TNF-α和IL-6的浓度。发现在不给予LPS刺激的情况下,3种基因型mRNA表达和TNF-α和IL-6的浓度具有显著性差异,携带AA基因型的个体TIRAP mRNA表达和PBMCs上清液TNF-α/IL-6的浓度明显高于携带AG和GG基因型个体;LPS刺激后,携带AA基因型的个体TIRAP mRNA的表达和TNF-α和IL-6的浓度明显高于携带AG和GG基因型的个体。.TLR-NF-κB信号传导通路在ALI/ARDS的发病机制中具有重要的作用,我们选择编码信号通路蛋白的4个关键基因进行研究(IRAK4、IRAK1、MyD88和TRAF6)。利用Beckman分型平台对276例脓毒症对照和272例脓毒症诱导的ALI/ARDS患者进行基因分型,研究发现位于TRAF6基因内含子区域的rs4755453与中国汉族人群ALI/ARDS的易感性显著相关。为阐明rs4755453影响ALI/ARDS的发病机制,我们进行了后续的功能研究。共选择90个携带不同基因型的健康个体,分离外周血PBMCs并进行培养,给予LPS刺激后提取PBMCs RNA和分离细胞培养上清液。发现在不给予LPS刺激和LPS刺激后,携带GG基因型的个体TRAF6 mRNA的表达量和PBMCs上清液TNF-α和IL-6的浓度明显高于携带GC和CC基因型的个体。.本课题通过分子遗传学研究发现TIRAP和TRAF6基因变异与中国汉族人群ALI/ARDS发病的易感性有关,并借助体外的功能研究阐述了基因变异影响个体发病的机制。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:--
发表时间:2013
期刊:中华急诊医学杂志
影响因子:--
作者:宋振举
通讯作者:宋振举
Variants in the Toll-interacting protein gene are associated with susceptibility to sepsis in the Chinese Han population.
Toll相互作用蛋白基因的变异与中国汉族人群败血症的易感性相关
DOI:10.1186/cc9413
发表时间:2011
期刊:Critical care (London, England)
影响因子:--
作者:Song Z;Yin J;Yao C;Sun Z;Shao M;Zhang Y;Tao Z;Huang P;Tong C
通讯作者:Tong C
DOI:10.1186/1471-2350-11-168
发表时间:2010-11-30
期刊:BMC medical genetics
影响因子:--
作者:Song Z;Tong C;Sun Z;Shen Y;Yao C;Jiang J;Yin J;Gao L;Song Y;Bai C
通讯作者:Bai C
Genetic variation in the TNF receptor-associated factor 6 gene is associated with susceptibility to sepsis-induced acute lung injury.
TNF 受体相关因子 6 基因的遗传变异与脓毒症引起的急性肺损伤的易感性相关
DOI:10.1186/1479-5876-10-166
发表时间:2012-08-17
期刊:Journal of translational medicine
影响因子:7.4
作者:Song Z;Yao C;Yin J;Tong C;Zhu D;Sun Z;Jiang J;Shao M;Zhang Y;Deng Z;Tao Z;Sun S;Bai C
通讯作者:Bai C
DOI:10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2012.03.031
发表时间:2012-03
期刊:中华急诊医学杂志
影响因子:--
作者:宋振举
通讯作者:宋振举
GPR174通过RAPGEF2激活Ras-MAPK途径调控脓毒症肠道树突状细胞成熟的分子机制
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    宋振举
  • 依托单位:
GPR174调控肠道树突状细胞功能影响脓毒症肠道免疫的机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    宋振举
  • 依托单位:
经典HLA基因遗传变异对汉族人群严重脓毒症易感性影响的关联研究和机制探讨
  • 批准号:
    81471840
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    72.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    宋振举
  • 依托单位:
国内基金
海外基金