中国已成为世界上第三大生产地区和第一大出口国，番茄酱出口份额占到全世界的30%。膜下滴灌栽培技术是各主要种植区的主导栽培模式，在这种栽培模式下，根腐病的危害日益严重。本研究以前期筛选的对根腐病有很好防效的枯草芽孢杆菌S44为研究目标，用绿色荧光蛋白基因进行标记，采用选择性培养基记数法、荧光显微镜观测法和特异性引物PCR扩增来监测生防菌滴施到加工番茄根际后的定殖规律；分别采用细菌的16S rDNA通用引物和真菌的18S rDNA通用引物对加工番茄根面和根际不同部位土样的总DNA进行PCR扩增后，采用变性温度梯度凝胶电泳技术（DGGE）对生防菌随水滴施入加工番茄根际后与其他微生物之间的相互关系进行分析，同时对生防菌菌体以及发酵液的不同活性组分进行纯化和作用机理研究，最终阐明滴灌条件下枯草芽孢杆菌S44的防病机理，为进一步提高该生防菌的防病效能提供理论依据。