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基于通用CPU SIMD指令集的基因序列联配高性能算法研究
结题报告
批准号：
60372040
项目类别：
面上项目
资助金额：
7.0 万元
负责人：
冯圣中
依托单位：
学科分类：
F0113.信息获取与处理
结题年份：
2004
批准年份：
2003
项目状态：
已结题
项目参与者：
张法、李玉岗、焦移山、曹振南、唐淼淼、冯高锋、徐琳、徐竞
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
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中文摘要
本项目将以面向SIMD的启示性优化算法为主要研究内容。以动态规划算法思想改造启示性算法，提高其敏感性；同时面向SIMD指令集，优化算法，减少条件转移、规整循环体结构，大幅提高计算速度。进一步，在广泛考察和深入分析生物信息处理算法基础上，提炼出生物信息处理基本算法，并开展优化设计研究。.生物信息处理与传统的科学计算差异巨大：生物信息处理主要为定点计算、循环迭代规模不确定、条件转移指令比较多，目前还没
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