课题基金 / 基金详情

基于通用CPU SIMD指令集的基因序列联配高性能算法研究

批准号:
60372040
项目类别:
面上项目
资助金额:
7.0 万元
负责人:
冯圣中
学科分类:
信息获取与处理
结题年份:
2004
批准年份:
2003
项目状态:
已结题
项目参与者:
张法、李玉岗、焦移山、曹振南、唐淼淼、冯高锋、徐琳、徐竞

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
本项目将以面向SIMD的启示性优化算法为主要研究内容。以动态规划算法思想改造启示性算法,提高其敏感性;同时面向SIMD指令集,优化算法,减少条件转移、规整循环体结构,大幅提高计算速度。进一步,在广泛考察和深入分析生物信息处理算法基础上,提炼出生物信息处理基本算法,并开展优化设计研究。.生物信息处理与传统的科学计算差异巨大:生物信息处理主要为定点计算、循环迭代规模不确定、条件转移指令比较多,目前还没
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