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剪接体组分蛋白USP39及其动态修饰在肝癌发生发展中的作用和机制研究

批准号:
82073127
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
李妍
依托单位:
学科分类:
肿瘤遗传与进化
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
李妍

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
探究肝癌的发生发展机制,寻找有效治疗靶标是目前肝癌诊治的迫切需要。可变剪接已成为肿瘤研究领域的前沿和热点,然而剪接体组分蛋白在肝癌中的具体功能和作用机理还有待阐明。由于剪接体蛋白在肿瘤中经常有表达或动态修饰异常的现象,我们对TCGA、GEO等数据库中的肝癌病例进行分析,发现USP39在癌组织中广泛高表达且与临床病理进程相关联。应激状态下,USP39受到乙酰化及SUMO化修饰,进而调节其功能与活性。随后,我们通过构建条件性敲除小鼠模型证明抑制USP39表达可减缓肝癌发生发展。对这些组织样品进行RNA-seq后分析发现,USP39敲除广泛影响可变剪接。在此基础上,本项目拟进一步明确USP39在不同诱因的转基因小鼠肝癌模型中的作用;深入研究USP39表达异常或动态修饰异常对mRNA可变剪接的分子调控机制。从而明确USP39作为肝癌干预新靶点的临床意义,为肝癌的有效治疗和药物开发提供理论基础。
英文摘要
In order to improve the clinical diagnosis and treatment for hepatocellular carcinoma (HCC), it’s urgently needed to explore the mechanism of HCC carcinogenesis as well as develop effective therapeutic targets. Research on alternative splicing (AS) has become hotspot and frontier in cancer research. However, the functional roles of spliceosome proteins and their underlying mechanisms in HCC development remain unclear. As the expression and modification of spliceosome proteins are frequently deregulated during tumorigenesis, we started to analyze HCC cases in TCGA and GEO databases. The result showed that USP39 was frequently over-expressed in HCC tumor samples and its expression correlated with clinical pathological progression. Under cellular stresses, USP39 was post-translationally acetylated and SUMOylated, which modulated its function and activity. Using conditional knock-out mice model, we showed that USP39 suppression could inhibit HCC development. Transcriptome sequencing analysis on these mice tissues showed that USP39 knock-out had widespread influence on AS. In current project, we intend to further identify the roles of USP39 using various transgenic mice HCC models. The effects of USP39 expression and modification deregulation in AS modulation and its underlying mechanisms will be further elucidated. The results would testify the possibility of clinically targeting USP39, and hopefully pave the way for HCC treatment and drug development.
中文摘要(对项目的背景、主要研究内容、重要结果、关键数据及其科学意义等做简单概述):.探究肝细胞癌(HCC)的发生发展机制,寻找有效治疗靶标是目前肝癌诊治的迫切需要。可变剪接已成为肿瘤研究领域的前沿和热点,然而剪接体组分蛋白在肝癌中的具体功能和作用机理还有待阐明。USP39是剪接体U4/U6. U5 tri-snRNP的关键组分之一,我们对TCGA、GEO等数据库中的HCC病例进行分析 ,发现USP39在癌组织中广泛高表达且与临床病理进程相关联。氧化应激状态下,USP39 431位赖氨酸乙酰化水平降低,该位点的去乙酰化修饰与肝癌发生和细胞增殖密切相关。随后,我们通过构建条件性敲入小鼠模型证明USP39过表达在体内具有促癌作用;在人HCC细胞系中证明了USP39促进肿瘤细胞增殖和细胞周期,且该作用依赖于剪接体形成。USP39敲低细胞系和过表达小鼠的RNA-seq结果均显示USP39调控的差异表达基因及可变剪接事件多富集于细胞周期和有丝分裂等通路。USP39调控包括KANK2在内的目标基因的剪接位点选择,USP39过表达通过促进KANK2第二外显子保留,提高其翻译效率,从而促进细胞增殖和细胞周期。分子机制方面,基于RNA-seq的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP)识别基序富集分析表明USP39对剪接位点的选择可能与结合在pre-mRNA特定位置的RBP相关,其中USP39与HNRNPC/SRSF6蛋白的互作得到了验证。综上,本项目证明了USP39可以通过与SRSF6/HNRNPC等RBP互作,特异性调控某些细胞周期、有丝分裂相关通路基因的可变剪接,从而促进HCC发生发展,具有作HCC诊断和治疗靶点的潜力。
ASH1L介导肝癌细胞与肝星状细胞协同促进肝癌发生发展的作用及机制研究
  • 批准号:
    82372768
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    49万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    李妍
  • 依托单位:
UHRF1调控肿瘤干细胞影响肝癌进程的作用及机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    李妍
  • 依托单位:
RNA编辑调控细胞干性及促进肝癌干细胞形成的机制研究
  • 批准号:
    81702798
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    李妍
  • 依托单位:
国内基金
海外基金