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细菌基因组DNA磷硫酰化修饰的位点选择及其机理研究

批准号：
30870038
项目类别：
面上项目
资助金额：
40.0 万元
负责人：
梁晶丹
依托单位：
上海交通大学
学科分类：
微生物组学与代谢
结题年份：
2011
批准年份：
2008
项目状态：
已结题
项目参与者：
王后根、刘倩、谢新强、徐飞
关键词：
基因组修饰位点DNA修饰DndE.coliB7ADNA磷硫酰化修饰

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项目成果

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中文摘要
细菌DNA磷硫酰化修饰是首次发现的DNA磷酸骨架上的生理修饰。项目拟对含有DNA硫化修饰的E.coli B7A、Streptomyces lividans 1326、Streptomyces avermitilis、Salmonella enterica serovar Cerro isolates 87及Pseudomonas fluorescens PfO-1五个菌株的基因组具体修饰位点进行大规模鉴定。通过物种内修饰位点的DNA序列比对，求出修饰发生的保守顺序。利用已知的基因组序列对发生修饰的位点进行定位，统计修饰发生在基因间或基因内的比例，探索DNA硫化修饰的基因组位置规律性。通过体内遗传学和体外DNA-蛋白相互作用实验，确定相关Dnd蛋白的序列选择功能，为透彻阐明细菌磷硫酰化的生理意义奠定基础。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
过氧乙酸-TAE缓冲液对硫修饰DNA切割条件的优化
DOI： --
发表时间： --
期刊： 上海交通大学学报
影响因子： --
作者： [ZHOU Xiu-fen, LIANG Jing-dan, WANG Zhi-jun, DENG Zi-xin, 邓子新, 周秀芬, 梁晶丹, 汪志军]
通讯作者： 汪志军
Two pHZ1358 Derivative Vectors for Efficient Gene Knockout in Streptomyces
两种用于链霉菌中高效基因敲除的 pHZ1358 衍生载体
DOI： 10.4014/jmb.0910.10031
发表时间： 2010-04-01
期刊： JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
影响因子： 2.8
作者： [He Yunlong, Wang, Zhijun, Deng, Zixin]
通讯作者： Deng, Zixin
DNA phosphorothioation in Streptomyces lividans: mutational analysis of the dnd locus
浅青紫链霉菌中的 DNA 硫代磷酸化：dnd 位点的突变分析
DOI： 10.1186/1471-2180-9-41
发表时间： 2009-02-20
期刊： BMC MICROBIOLOGY
影响因子： 4.2
作者： [Xu, Tiegang, Liang, Jingdan, Deng, Zixin]
通讯作者： Deng, Zixin
Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the DndE protein from Salmonella enterica serovar Cerro 87, which is involved in DNA phosphorothioation
肠沙门氏菌 Cerro 87 血清型 DndE 蛋白的纯化、结晶和初步 X 射线分析，该蛋白参与 DNA 硫代磷酸化
DOI： 10.1107/s1744309111036694
发表时间： 2011-11-01
期刊： ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS
影响因子： 0.9
作者： [Chen, Fukun, Lin, Kui, Wu, Geng]
通讯作者： Wu, Geng
共 7 条
    Pyochelin非核糖体肽合酶亚基装配与催化机制研究
    • 批准号：
      32271302
    • 项目类别：
      --
    • 资助金额：
      54万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      梁晶丹
    • 依托单位：
      上海交通大学
    DNA硫化修饰的抗氧化机理研究
    • 批准号：
      31470830
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      85.0万元
    • 批准年份：
      2014
    • 负责人：
      梁晶丹
    • 依托单位：
      上海交通大学
    国内基金
    海外基金