甘蓝型油菜每角粒数主效QTL精细定位和侯选基因鉴定
批准号:
31101181
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
26.0 万元
负责人:
师家勤
依托单位:
学科分类:
作物基因组及遗传学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
王汉中、王新发、杨庆、黄顺谋、樊菲、李娜
中文摘要
油菜每角粒数遗传力高且对产量有很大贡献。利用在每角粒数上有极显著差异的油菜测序品种构建的分离群体,我们在A6染色体定位到一个稳定控制每角粒数的呈完全显性模式遗传的新主效QTL,其LOD值和贡献率都超过已往报道。以该主效QTL为目标,本项目利用连续回交结合分子标记辅助选择构建杂合QTL-NIL,并自交获得QTL-NIL分离群体;田间种植该群体,利用生物信息学方法在目标QTL区间逐步加密分子标记并对其进行基因型分析寻找交换单株,结合其每角果粒数的表型数据,将目标QTL逐步精细定位到100kb左右的标记区间内。最后,对QTL对应的精细物理图谱进行基因预测、注释和分类及亲本间SNP分析,确定2-3个候选基因。研究结果可用于分子标记辅助选择育种,也可为基因功能验证和油菜每角粒数及其杂种优势调控的分子机理研究奠定基础。利用QTL-NIL精细定位的方法可为油菜其它数量性状基因精细定位提供借鉴和参考。
英文摘要
为了精细定位目标主效QTL,我们利用其置信区间内开发的6个高质量共显性分子标记对5047个BC4F2单株进行基因型分析筛选重组单株。在成熟期,我们收获了重组单株并对其进行每角粒数的考种。我们通过比较10种不同类型重组单株和轮回亲本中双11在每角粒数上的差异,将目标主效QTL进一步锁定到标记BrSF47-10和BrSF46-167之间。该标记区间对应白菜物理图谱329 kb,含62个注释基因。最后,我们通过生物信息学分析确定了目标主效QTL区间内的两个侯选基因。
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Genome-Wide Microsatellite Characterization and Marker Development in the Sequenced Brassica Crop Species
已测序芸苔属作物物种的全基因组微卫星表征和标记开发
DOI:
10.1093/dnares/dsu011
发表时间:
2014-04-03
期刊:
DNA Research: An International Journal for Rapid Publication of Reports on Genes and Genomes
影响因子:
--
作者:
[Shi J, Huang S, Zhan J, Yu J, Wang X, Hua W, Liu S, Liu G, Wang H]
通讯作者:
Wang H
油菜杂种优势主效QTL-QC6调控每角粒数的生物学功能与分子机理解析
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批准号:32472218
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2024
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负责人:师家勤
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依托单位:
油菜一个新的粒重和角果长度多效性主效QTL的图位克隆和功能分析
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批准号:31771840
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2017
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负责人:师家勤
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依托单位:
国内基金
海外基金