南海北部地球物理科学考察航次在南海东北部和台湾海峡西部布设三条测线，其中1号测线深水段进行多道地震和高分辨率浅地层剖面调查，以获取陆坡区油气资源的赋存状态及其渗漏结构，揭示该区油气资源的分布状况和资源潜力，同时对该区的陆缘地壳结构进行研究；1号测线陆架段和另外两条测线则进行OBS折射地震调查，同步进行单道地震接收，以分析华南滨海断裂带两侧的地壳结构特征。通过这些测线的调查，研究南海北部海陆过渡带的地壳结构特征，确定该区强地震活动特征和区域地壳稳定性，调查南海东北部地区的油气资源分布状况，进而探讨南海北部的构造属性和形成演化过程。