课题基金基金详情
肿瘤细胞中反义链转录本调控DHRS4基因簇表达的机制研究
结题报告
批准号:
31071153
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
宋旭红
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
梁斌、谢健平、隋旭霞、闫银侠、林静、刘婷、常晓兰
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
结合最新热点,提供专业选题建议
深度指导申报书撰写,确保创新可行
指导项目中标800+,快速提高中标率
客服二维码
微信扫码咨询
中文摘要
反义链转录产生的非编码RNA在基因的转录、剪接和表达调控中发挥重要作用。辅酶II依赖视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)是体内atRA合成的重要酶类,其基因位于14q11.2,由三个基因构成(DHRS4,DHRS4L2,DHRS4L1)。我们在DHRS4基因簇结构功能和表达调控机制的研究中,首次在肿瘤细胞中发现并鉴定了大量反义链转录本的存在,这些转录本具备功能ncRNA的特点。我们推测,除基因表达调控的表观遗传学因素外,DHRS4基因的反义链转录产物可能以ncRNA的形式在DHRS4基因簇转录、剪接、表达调控中发挥重要作用。对这些反义转录产生的ncRNA作用方式和作用机制的深入阐释,将为揭示DHRS4基因簇表达调控的机制提供依据,对反义链转录和非编码RNA的功能研究以及维甲酸代谢调控机制研究均具有重要的理论价值。
英文摘要
辅酶II依赖视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)是体内全反式维甲酸(atRA)合成的重要酶类,人DHRS4是NRDR的编码基因,有2个同源基因DHRS4L2和DHRS4L1,3个基因构成基因簇串联排列于人类染色体14q11.2位点。我们在DHRS4基因簇结构功能和表达调控机制以及选择性剪接的研究中,首次在肿瘤细胞中发现并鉴定了大量反义链转录本的存在。基因组中从正义链或反义链转录的长的非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA),可以顺式或反式调控相邻基因或远距离基因的表达,并通过表观遗传调控机制来实现,如lncRNA可作为介导染色质表观遗传修饰的支架,招募相关的蛋白质、酶或RNA,以激活或抑制目的基因的表达,实现生理或病理状况下相关基因的表达调控。我们在人肝癌细胞株HepG2和人正常肝细胞株HL7702中,克隆获得DHRS4基因的两个反义链转录本,AS1DHRS4和AS2DHRS4,均为lncRNAs。AS1DHRS4存在于这两株细胞中,对于DHRS4基因簇的3个基因具有不同的转录调节作用,AS2DHRS4只存在于HepG2细胞中,它的功能目前尚不清楚。AS1DHRS4对DHRS4具有顺式调控作用,同时反式调控DHRS4L2和DHRS4L1基因表达。AS1DHRS4对DHRS4基因簇的表观遗传调控机制包括:① 介导DHRS4基因簇位点3个基因启动子区域的组蛋白H3去乙酰化和H3K4 me2去甲基化;② 与甲基转移酶G9a和EZH2相互作用,介导DHRS4L2和DHRS4L1启动子区域的抑制性组蛋白修饰H3K9 me2和H3K27 me3; ③ AS1DHRS4通过招募DNA甲基转移酶诱导DHRS4L2启动子区域的DNA甲基化,导致转录抑制。本课题研究以反义链转录产生的lncRNA为切入点,阐明了肿瘤细胞中DHRS4基因簇表达调控和复杂的选择性剪接的表观遗传学机制。研究内容和结果不仅丰富了反义链转录和lncRNA的功能及作用机制研究,同时对于维甲酸代谢调控机制的研究也具有重要的理论价值。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1016/j.gene.2011.12.033
发表时间:2012-02
期刊:Gene
影响因子:3.5
作者:Z. Su;Rui Li;Xuhong Song;Gefei Liu;Yifan Li;X. Chang;Cong-zhu Li;Dongyang Huang
通讯作者:Z. Su;Rui Li;Xuhong Song;Gefei Liu;Yifan Li;X. Chang;Cong-zhu Li;Dongyang Huang
AS1DHRS4, a head-to-head natural antisense transcript, silences the DHRS4 gene cluster in cis and trans
AS1DHRS4,一种头对头的天然反义转录物,以顺式和反式沉默 DHRS4 基因簇
DOI:10.1073/pnas.1116597109
发表时间:2012-08-28
期刊:PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子:11.1
作者:Li, Qi;Su, Zhongjing;Huang, Dongyang
通讯作者:Huang, Dongyang
DOI:--
发表时间:2011
期刊:实用肿瘤杂志
影响因子:--
作者:梁斌;刘戈飞;谢建平;李蕊;宋旭红
通讯作者:宋旭红
DOI:10.1159/000343326
发表时间:2012-11
期刊:Cellular Physiology and Biochemistry
影响因子:--
作者:Yinxia Yan;Xuhong Song;Gefei Liu;Z. Su;Yongming Du;Xuxia Sui;X. Chang;Dongyang Huang
通讯作者:Yinxia Yan;Xuhong Song;Gefei Liu;Z. Su;Yongming Du;Xuxia Sui;X. Chang;Dongyang Huang
NADP(H)依赖性视黄醇脱氢/还原酶的亚细胞新定位和新功能研究
  • 批准号:
    2020A1515010175
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    宋旭红
  • 依托单位:
国内基金
海外基金