F18大肠杆菌是目前养猪业中最普遍、危害最大的肠毒素大肠杆菌病原之一，迄今为止在国内地方猪种中还没有发现有应用价值的F18大肠杆菌病抗性遗传标记，因此对中国地方猪种F18大肠杆菌抗性主效基因的筛选与鉴定意义重大。本研究基于课题组已经建立的苏太猪F18大肠杆菌病抗性型和敏感型资源群体，以同一家系中具有极端表型（抗和不抗）的全同胞个体组成配对试验组，通过基因芯片结合抑制消减杂交分析，得到抗性和敏感性个体小肠组织差异表达基因；通过蛋白质组学分析，得到抗性和敏感性个体小肠组织差异表达的蛋白及其对应的基因。综合分析两类结果，初步确定对F18大肠杆菌病抗性具有调控作用的主效基因，并在太湖猪（梅山、二花脸和枫泾猪）群体中，通过多态性分析和体外黏附、体内定居相关试验，进一步验证抗性主效基因功能，揭示太湖猪对F18大肠杆菌的抗性遗传基础并确定相应分子遗传标记，最终为中国地方猪种的抗病育种工作奠定基础。