超活性mariner-like转座子的构建及在基因标签技术应用的探讨
结题报告
批准号:
31070590
项目类别:
面上项目
资助金额:
31.0 万元
负责人:
周明兵
依托单位:
学科分类:
C1610.林木遗传育种
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
ZsuzsannaIzsvak、郑康乐、徐川梅、杨海芸、高培军、董文娟、钟浩
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中文摘要
Mariner-Like转座子(Mariner-Like Elements, MLE)是DNA转座子的一个重要家族,该转座子具有异源转座率高、插入位点无偏好性、产生突变稳定等特点,在开发基因标签上优于其他类型的转座子。本课题计划在前一个国家自然基金项目(30371181)研究基础上,(1)以毛竹中一个具有天然活性的MLE转座子为基础,根据已经克隆到的竹亚科87个全长MLE转座子,结合生物信息学和分子生物学的技术和手段,对MLE转座子进行分子优化, 利用酵母转座表达系统,筛选出超活性的MLE转座子;(2)以超活性MLE转座子为基础,构建转座子标签系统,转化拟南芥,开发出植物首个MLE转座子标签系统,为大规模构建植物突变体库和研究基因功能提供新的工具;另一方面,基于竹亚科基因组信息开发出的MLE转座子标签系统,也将使竹亚科基因的分离与鉴定更加简单易行,会大大加快竹亚科基因组的研究进程。
英文摘要
Mariner-Like转座子(Mariner-Like Elements, MLE)是DNA转座子的一个重要家族,该转座子具有异源转座率高、插入位点无偏好性、产生突变稳定等特点,在开发基因标签上优于其他类型的转座子。本课题在国家自然基金项目资助下,(1)选取了来源毛竹基因组,保守性强的两个MLE转座子(Ppmar1和Ppmar2),通过酵母转座检测系统发现这两个转座子均能够在酵母基因组转座,(2)根据竹亚科MLE转座酶进化和变异模式,对Ppmar1和Ppmar2转座酶进行分子优化,利用酵母转座表达系统,共筛选出高活性的MLE转座酶26个,其中Ppmar1转座酶活性最高提高到原来的2.2倍,Ppmar2转座酶活性最高提高到原来的3.2倍;(3)以超活性MLE转座子为基础,构建转座子标签系统,转化拟南芥,开发出植物首个MLE转座子标签系统,为大规模构建植物突变体库和研究基因功能提供新的工具;基于竹亚科基因组信息开发出的MLE转座子标签系统,也将使竹亚科基因的分离与鉴定更加简单易行,会大大加快竹亚科基因组的研究进程。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.4238/2011.december.6.3
发表时间:2011-12
期刊:Genetics and molecular research : GMR
影响因子:--
作者:Mingbing Zhou;X. M. Liu;D. Tang
通讯作者:Mingbing Zhou;X. M. Liu;D. Tang
DOI:--
发表时间:2012
期刊:福建林业科技
影响因子:--
作者:郑丽娜;周明兵
通讯作者:周明兵
基于碳纳米管技术和转座子开发一种新型的、 marker-free 的植物转基因技术
  • 批准号:
    Z24C160005
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    周明兵
  • 依托单位:
毛竹LTR反转录转座子响应环境变化的分子机理
  • 批准号:
    31870656
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    周明兵
  • 依托单位:
毛竹MLE(mariner-like element)转座酶催化机理研究
  • 批准号:
    LZ19C160001
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    周明兵
  • 依托单位:
毛竹LTR反转录转座子转座调控机理及对宿主生物多样性的影响
  • 批准号:
    31470615
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    87.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    周明兵
  • 依托单位:
毛竹活性MITE的分离及与宿主基因表达调控网络互作机制解析
  • 批准号:
    31270645
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    周明兵
  • 依托单位:
国内基金
海外基金