课题基金 / 基金详情

DNA修复基因3'-UTR遗传变异与肝细胞肝癌发生风险及其机制研究

批准号:
81460516
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
余红平
依托单位:
学科分类:
非传染病流行病学
结题年份:
2018
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
黄波、贝春华、缪雪艳、于祥远、秦林原、张瑛、邱模勤、刘伟、闫萌

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
广西是我国肝细胞肝癌(HCC)高发区,其死亡率居广西肿瘤死因谱首位。HCC发生是环境与遗传因素共同作用的结果,但其发病机制尚不很清楚。人类细胞DNA修复系统在防止细胞恶性转化过程起关键作用。miRNA通过与其靶mRNA 3'-UTR结合,导致mRNA降解或翻译抑制,从而负调控基因表达,与肿瘤发生密切相关。3'-UTR miRNA结合区域SNP可通过影响miRNA与其靶序列结合而影响miRNA功能。本课题基于生物信息方法筛选出的DNA修复基因3'-UTR miRNA结合区域SNPs,运用病例对照研究方法,探讨SNPs与HCC发生风险的关系,分析基因-基因及基因-环境交互作用;在此基础上,采用系列细胞、分子生物学方法,探讨显著关联SNPs的功能学意义,揭示DNA修复基因3'-UTR遗传变异在HCC发病中的可能生物学机制,筛选出HCC易感性标志物,为HCC个体化预防、干预和治疗等提供重要理论依据
英文摘要
Guangxi is one of areas for the highest incidence of Hepacellular carcinoma (HCC) in China. HCC is also the leading cause of cancer death in Guangxi. Both environmental and genetic factors contribute to the etiology of HCC, but the mechanisms of HCC are not clear. Cellular DNA repair system plays a critical role in cell malignant transformation. miRNAs negatively regulate gene expression by recognizing partially complementary sequences in the 3'-UTR of their target mRNAs. It has been known that miRNAs play a major role in cancer development. SNPs in the miRNA-binding sites (mir-SNPs) within the 3'-UTR may interfere with miRNA gene regulation and affect cancer susceptibility by altering miRNA-mRNA interactions. mir-SNPs within the 3'-UTR of the important DNA repair genes were predicted and screened by using bioinformatics approaches in our preliminary work. In this molecular case-control study, we will investigate the associations of the screened mir-SNPs and interactions of gene-gene/gene-environment (HBV infection, smoking and drinking, etc.) with HCC risk and indentify significant mir-SNPs associated with HCC risk. Furthermore, the biological function of significant mir-SNPs will be investigated using a series of cell-based assays and molecular biology techniques. This study may elucidate the biological mechanism of genetic variants in the 3'-UTR of DNA repair genes in the pathogenesis of HCC, and provide important evidence for personal prevention, intervention and treatment of HCC in future.
广西是我国肝细胞肝癌(HCC)高发区,其死亡率居广西肿瘤死因谱首位。HCC 发生是环境与遗传因素共同作用的结果,但其发病机制尚不很清楚。人类细胞 DNA 修复系统在防止细胞恶性转化过程起关键作用。miRNA 通过与其靶 mRNA 3'-UTR 结合,导致 mRNA 降解或翻译抑制,从而负调控基因表达,与肿瘤发生密切相关。3'-UTR miRNA 结合区域 SNP 可通过影响 miRNA 与其靶序列结合而影响 miRNA 功能。本课题选择了位于19个DNA修复基因3’-UTR区域miRNAs结合位点的23个SNPs,采用以医院为基础的病例-对照研究方法,研究这些SNPs及其与吸烟、饮酒、HBV感染等环境暴露因素的交互作用与HCC易感性的关系。我们通过对选取的1114例确诊的HCC新发病例和1208例非肿瘤患者进行候选SNPs基因分型,应用单因素、多因素Logistic回归统计方法,评价其基因型频率分布及其与HCC遗传易感性的关系。结果发现,DDB2基因rs1050244位点与HBV感染在HCC发病风险中存在交互作用,其T等位基因是广西地区HBV感染阴性人群HCC的保护等位基因;LIG4 基因rs10131位点分别与吸烟、饮酒在HCC发病风险中存在交互作用,其C等位基因是广西地区吸烟、饮酒人群HCC的危险等位基因;RAD51D基因rs12947947、rs28363292位点在HCC发病风险中存在联合作用,rs28363292位点G等位基因可能是广西地区人群HCC的危险等位基因;RAD52基因rsl051669、rsl051672位点分别与性别在HCC发病风险中存在交互作用, rsl051669位点C等位基因和rsl051672 位点G等位基因可能是广西地区女性人群HCC的危险等位基因。该研究结果提示DNA修复基因3’-UTR区域miRNAs结合位点上的SNPs联合作用或与吸烟、饮酒、HBV感染等环境暴露因素的交互作用对HCC的遗传易感性有影响。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: 10.16073/j.cnki.cjcpt.2015.21.002
发表时间: 2015
期刊: 中华肿瘤防治杂志
影响因子: --
作者: [邱模勤, 于祥远, 秦林原, 王倩倩, 李强, 贝春华, 曾小云, 仇小强, 彭涛, 黎乐群, 余红平]
通讯作者: 余红平
DOI: --
发表时间: 2018
期刊: 中国癌症防治杂志
影响因子: --
作者: [王坚武, 于祥远, 王倩倩, 秦林原, 贝春华, 谭盛葵, 何松青, 唐博, 廖维甲, 余红平]
通讯作者: 余红平
Association between miR-199a rs74723057 and MET rs1621 polymorphisms and the risk of hepatocellular carcinoma.
miR-199a rs74723057和MET rs1621多态性与肝细胞癌风险的关联
DOI: 10.18632/oncotarget.13033
发表时间: 2016-11-29
期刊: Oncotarget
影响因子: --
作者: [Wang Q, Yu X, Li Q, Qin L, Tan S, Zeng X, Qiu X, Tang B, Jin J, Liao W, Qiu M, Tan L, He G, Li X, He S, Yu H]
通讯作者: Yu H
DOI: --
发表时间: 2017
期刊: 桂林医学院硕士学位论文
影响因子: --
作者: [王倩倩, 余红平]
通讯作者: 余红平
共 8 条
    易感基因FAM114A1通过HMGCS2抑制线粒体自噬促进肝细胞癌发生的作用机制
    • 批准号:
      82460668
    • 项目类别:
      地区科学基金项目
    • 资助金额:
      32.00万元
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      余红平
    • 依托单位:
    肝细胞癌相关miRNAs遗传变异与疾病易感性及其功能的研究
    • 批准号:
      81660567
    • 项目类别:
      地区科学基金项目
    • 资助金额:
      37.0万元
    • 批准年份:
      2016
    • 负责人:
      余红平
    • 依托单位:
    广西肝癌高发区环境暴露、DNA修复基因多态性与肝细胞癌的关系
    • 批准号:
      30660162
    • 项目类别:
      地区科学基金项目
    • 资助金额:
      22.0万元
    • 批准年份:
      2006
    • 负责人:
      余红平
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金