类泛素家族蛋白NEDD8,SUMO,Pup和SAMPs的结构和功能研究

批准号:
31270780
项目类别:
面上项目
资助金额:
90.0 万元
负责人:
涂晓明
依托单位:
学科分类:
C0501.结构生物学
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
王涛、廖善晖、戴昆、叶开琴、王瑞、梅松、吴学雷
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中文摘要
依赖泛素及类泛素蛋白的翻译后修饰已经被证实参与几乎所有细胞内的调控过程,这些细胞事件包括转录调控、DNA损伤修复、信号转导、细胞凋亡以及细胞周期调控等。近年来随着原核生物和古细菌的类泛素家族蛋白的发现,对该家族蛋白的结构和功能有了许多新的认识,同时也提出了更多需要探索的问题。本项目将围绕着类泛素家族蛋白NEDD8,SUMO,Pup和SAMPs的结构和功能开展相关的研究。重点研究真核生物锥体虫NEDD8和SUMO系统的分子作用机制及其在细胞内的功能;原核生物Pup的构象及其和底物识别中的构象变化;以及古细菌SAMPs的结构及其分子作用机制。通过对从真核生物,原核生物到古细菌的类泛素家族蛋白的全面系统的研究,从而深入了解类泛素家族蛋白的结构和功能及其演化发展。
英文摘要
Ubiquitin and ubiquitin-like dependent post-translational modifications have been comfirmed to be invovled in diverse biological processes, including transcriptional regulation, DNA damage repair, signal transduction, apoptosis and cell cycle regulation, etc. In recent years, the discovery of ubiquitin-like family proteins from prokaryote and archaea brings us a lot of novel knowledge of the structure and function of this family proteins, and raises more issues to be explored as well. In this project, we will study the structure and function of ubiquitin-like family proteins NEDD8, SUMO, Pup and SAMPs. We will focus on the molecular mechanism of NEDD8 and SUMO system and their cellular functions in eukaryotic organism Trypanosoma brucei; the conformation of prokaryotic Pup and its conformational transition upon substrate binding; and the structure of archaeal SAMPs and their moleuclar mechanism. By comprehensive and systematic study of these ubiquitin-like family proteins from eukaryote, prokaryote to archaea, we can understand in depth the structure and function of ubiquitin-like family proteins and their evolution.
依赖泛素及类泛素蛋白的翻译后修饰已经被证实参与几乎所有细胞内的调控过程,这些细胞事件包括转录调控、DNA损伤修复、信号转导、细胞凋亡以及细胞周期调控等。近年来随着原核生物和古细菌的类泛素家族蛋白的发现,对该家族蛋白的结构和功能有了许多新的认识,同时也提出了更多需要探索的问题。本项目围绕着类泛素家族蛋白NEDD8,SUMO,SAMPs和Pup的结构和功能开展相关的研究。我们解析了布氏锥虫类泛素蛋白NEDD8的溶液空间结构,完成了类泛素蛋白NEDD8的细胞功能研究,NEDD8系统的相关酶和修饰底物的鉴定。我们完成了布氏锥虫中SUMO化系统的酶的鉴定,构建了体外SUMO化系统,通过体外SUMO化实验验证了酶的活性以及SUMO的底物。我们还完成了古细菌类泛素蛋白SAMP1和SAMP2的的NMR溶液结构解析,研究了SAMPs在盐离子影响下的构象的变化。此外,利用NMR核磁共振,圆二色谱(CD)和表面等离子体共振 (SPR)等方法我们研究了Pup和Mpa的相互作用,以及不同pH等条件对Pup构象及其与Mpa的相互作用的影响。通过对从真核生物,原核生物到古细菌的类泛素家族蛋白的全面系统的研究,将有助于我们深入了解类泛素家族蛋白的结构和功能及其演化发展。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Solution structure of Q388A3 PDZ domain from Trypanosoma brucei
布氏锥虫 Q388A3 PDZ 结构域的溶液结构
DOI:--
发表时间:2016
期刊:Journal of Structural Biology
影响因子:3
作者:涂晓明;涂晓明
通讯作者:涂晓明
Solution structure of leptospiral LigA4 Big domain
钩端螺旋体LigA4大域的溶液结构
DOI:--
发表时间:2015
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
影响因子:3.1
作者:Song Mei;Jiahai Zhang;Xuecheng Zhang;Xiaoming Tu
通讯作者:Xiaoming Tu
DOI:10.1002/pro.2302
发表时间:2013-09
期刊:Protein Science
影响因子:8
作者:Kaiqin Ye;S. Liao;Wen Zhang;K. Fan;Xuecheng Zhang;Jiahai Zhang;Chao Xu;X. Tu
通讯作者:Kaiqin Ye;S. Liao;Wen Zhang;K. Fan;Xuecheng Zhang;Jiahai Zhang;Chao Xu;X. Tu
Structural and functional insight into ADF/cofilin from Trypanosoma brucei.
从布氏锥虫中了解 ADF/Cofilin 的结构和功能
DOI:10.1371/journal.pone.0053639
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Dai K;Liao S;Zhang J;Zhang X;Tu X
通讯作者:Tu X
Induced folding under membrane mimetic and acidic conditions implies undiscovered biological roles of prokaryotic ubiquitin-like protein Pup
在膜模拟和酸性条件下诱导折叠意味着原核泛素样蛋白 Pup 尚未发现的生物学作用
DOI:--
发表时间:2016
期刊:Protein and Peptide Letters
影响因子:1.6
作者:涂晓明;涂晓明
通讯作者:涂晓明
布氏锥虫中动点蛋白和动点蛋白复合物的结构和功能研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58万元
- 批准年份:2020
- 负责人:涂晓明
- 依托单位:
布氏锥虫中识别甲基化、乙酰化组蛋白的蛋白结构域的结构和功能研究
- 批准号:U1332137
- 项目类别:联合基金项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2013
- 负责人:涂晓明
- 依托单位:
锥体虫Ubls蛋白家族SUMO和Urm1的结构和功能的研究
- 批准号:30770443
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:涂晓明
- 依托单位:
锥体虫动点相关蛋白Mad2,Skp1,TOG和中心体相关蛋白Spc97,Spc98在有丝分裂中的功能研究
- 批准号:30600322
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:26.0万元
- 批准年份:2006
- 负责人:涂晓明
- 依托单位:
国内基金
海外基金
