课题基金 / 基金详情

结核感染免疫应答差异基因的eQTL定位及功能研究

批准号:
81373064
项目类别:
面上项目
资助金额:
85.0 万元
负责人:
张文宏
依托单位:
学科分类:
传染病流行病学
结题年份:
2017
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
陈嘉臻、吴晶、王森、赵晶、沈瑶杰、刘袁媛、孙峰、鲍磊

项目摘要

结项摘要

项目成果

张文宏的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
结核感染后最终是否发展为活动性结核病与宿主免疫系统对结核的免疫应答强度有关。申请人前期发现,潜伏性结核感染和活动性结核患者外周血单个核细胞在特异性结核多肽抗原刺激后,存在细胞因子表达及转录组水平上的差异,筛选并验证了包括CXCL10 在内的多个免疫应答相关基因在转录水平及表达水平上存在显著差异,提示这些特定免疫应答相关基因与结核感染后发病密切相关。我们拟进一步运用表达数量性状座位(eQTL)分析策略,将前期发现与结核发病显著相关的关键基因的表达量作为数量性状,在活动性结核及潜伏性结核感染人群中进行遗传基因关联分析及定位;将定位的SNPs在人群队列中进行遗传学验证,最终选择与结核活动显著相关的SNP作进一步的功能研究。本课题在前期发现的结核感染免疫应答差异基因基础上,有望定位到中国人群的结核遗传易感基因,对其功能的鉴定将进一步揭示导致结核易感的分子机制。
英文摘要
Host immune response is the key factor to determine whether tuberculosis infection would eventually develop into active disease. In previous studies, we have compared the differences of cytokines and transcriptomics in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) between latent tuberculosis infection and active tuberculosis. We have found and verified significant differences in both expressional and transcriptional levels of a number of genes and cytokines, including C-X-C motif chemokine 10 (CXCL10), suggesting these genes might be associated with tuberculosis infection and pathogenesis. The result was confirmed by several overseas research teams. With these key genes, we intend to use the expression quantitative trait loci (eQTL) analysis strategy to do tubercular genetic association analysis and positioning in Chinese population, taking the expression of these genes as quantitative traits. After locating SNPs associated with expression, we plan to verify them in tuberculosis patients in cellular level, which are expected to clarify the susceptibility genes of tuberculosis in Chinese population and to explain the mechanisms of susceptibility as well.
申请人通过双重荧光反转录多重连接依赖式探针扩增技术检测了潜伏性结核感染和活动性结核患者外周血21个靶基因的表达量,验证了包括IL8,TNFRSF1B, BLR1, TIMP2, IL7R和TNFRSF10C等在内的多个免疫应答相关基因在转录水平及表达水平上存在显著差异。提示这些特定免疫应答相关基因与结核感染后发病密切相关。我们进一步运用表达数量性状座位(expression Quantitative Trait Loci, eQTLs)分析策略,通过PLINK 的混合线性模型进行数量性状关联分析。基于关联分析结果,发现与关联基因的表达水平显著关联的染色体SNP 区段(P<1e-5)。通过STRING 蛋白相互作用和蛋白功能相关性数据检索分析,发现差异表达的基因及其eQTLs关联位点TACR3,ADRA2C,FPR1,IL8,CCL19,PTPRU,CALM2处于一个互作调控网络中。研究人员进一步募集具有活动性结核患者103 例及结核潜伏感染者208 例,订制SNP 芯片,将eQTL 中筛选到的表达差异相关的SNPs 在两类人群中进行检测,通过验证,rs4654400 及rs62292160位点在两组人群中差异表达,提示其可能为中国人群的结核遗传易感基因,进一步揭示导致结核易感的分子机制。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Nucleos(t)ide analogue interruption: Alternative approach to intrahepatic set point for spontaneous control of HBV replication?
核苷(酸)类似物中断:自发控制 HBV 复制的肝内设定点的替代方法?
DOI: 10.1016/j.jhep.2017.09.026
发表时间: 2017-10
期刊: Jounal of Hepatology
影响因子: --
作者: [Yiqi Yu, Jing Wang, Guojun Li, Chuan Shen, Shaolong Chen, Jun Huang, Xinyu Wang, Caiyan Zhao, Yuxian Huang, Bin Wang, Xuanyi Wang, Jiming Zhang, Qiu Chao, Wenhong Zhang]
通讯作者: Wenhong Zhang
Relationship between serum HBV-RNA levels and intrahepatic viral as well as histologic activity markers in entecavir-treated patients
恩替卡韦治疗患者血清 HBV-RNA 水平与肝内病毒及组织学活性标志物之间的关系。
DOI: 10.1016/j.jhep.2017.08.021
发表时间: 2018-01-01
期刊: JOURNAL OF HEPATOLOGY
影响因子: 25.7
作者: [Wang, Jing, Yu, Yiqi, Zhang, Wenhong]
通讯作者: Zhang, Wenhong
DOI: 10.1128/aac.03504-14
发表时间: 2015-02-01
期刊: ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY
影响因子: 4.9
作者: [Wang, Feifei, Shao, Lingyun, Zhang, Wenhong]
通讯作者: Zhang, Wenhong
Splicing Variants of HBV RNA in Sera of Patients Receiving Nucleos(t)ide Analogues Therapy
接受核苷(酸)类似物治疗的患者血清中 HBV RNA 的剪接变异体
DOI: --
发表时间: 2017
期刊: Journal of Hepatology
影响因子: 25.7
作者: [Jing Wang, Yiqi Yu, Zhefeng Meng, Chuan Shen, Miaoqu Zhang, Peiyu Qian, Caiyan Zhao, Xuanyi Wang, Yuxian Huang, Jiming Zhang, Chao Qiu, Wenhong Zhang]
通讯作者: Wenhong Zhang
主要奥密克戎进化分支感染后长新冠发生水平及特征研究(基于多队列人群在高强度流行期间新冠病毒感染比较研究项目之四)
  • 批准号:
    82341033
  • 项目类别:
    专项基金项目
  • 资助金额:
    250万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    张文宏
  • 依托单位:
呼吸系统感染与宿主反应特征标识筛查及快速检测方法研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    --
  • 资助金额:
    270万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    张文宏
  • 依托单位:
新冠DNA疫苗受试者免疫应答相关因素及机制研究
  • 批准号:
    82161138018
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    280万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    张文宏
  • 依托单位:
2019-nCoV“不典型症状”感染者的宿主因素及其作用机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    专项基金项目
  • 资助金额:
    150万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    张文宏
  • 依托单位:
国内基金
海外基金