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有限和无限阶后缀排序关键算法研究
结题报告
批准号:
60873056
项目类别:
面上项目
资助金额:
31.0 万元
负责人:
农革
依托单位:
学科分类:
F0201.计算机科学的基础理论
结题年份:
2011
批准年份:
2008
项目状态:
已结题
项目参与者:
黄剑、李小霞、李令雄、周智勇、孙冉、杜瑞罡、高娜、杨震、王密
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
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中文摘要
信息科技和应用的发展,对信息处理系统的存储和处理能力的要求越来越高。后缀排序相关算法在数据压缩和字串匹配领域里有重要应用。结合项目组近年在后缀排序相关问题上的研究积累,本项目书提出对有限及无限阶后缀排序的关键算法围绕以下几个问题作进一步深入研究:(i)直接计算有限阶后缀排序的线性算法。(ii)具有理论线性复杂度,而且在实践中有良好性能的后缀排序算法。(iii)后缀排序算法在网络环境中的实时应用关键算法。实现以下目标:(1)研究时空复杂度均为线性O(n)的逆ST新算法,突破逆ST算法的复杂度瓶颈。(2)研究新的"切分-合并"方法,设计时空复杂度均优于现存无限阶后缀排序线性算法的新算法。(3)基于(1)和(2)的成果,研究直接计算有限阶后缀排序的快速线性算法以及索引查找算法。(4)用C++实现一个包括以上研究成果的函数库。
英文摘要
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Two Efficient Algorithms for Linear Time Suffix Array Construction
两种高效的线性时间后缀数组构建算法
DOI:10.1109/tc.2010.188
发表时间:2011-10-01
期刊:IEEE TRANSACTIONS ON COMPUTERS
影响因子:3.7
作者:Nong, Ge;Zhang, Sen;Chan, Wai Hong
通讯作者:Chan, Wai Hong
Computing the Inverse Sort Transform in Linear Time
在线性时间内计算逆排序变换
DOI:--
发表时间:--
期刊:ACM Transactions on Algorithms
影响因子:1.3
作者:Ge NONG;Wai Hong CHAN;Sen ZHANG
通讯作者:Sen ZHANG
Parallel Progressive Multiple Sequence Alignment on Reconfigurable Mesh
可重构网格上的并行渐进多序列对齐
DOI:--
发表时间:--
期刊:BMC Genomics
影响因子:4.4
作者:Ge NONG;Yi PAN;Ken D NGUYEN
通讯作者:Ken D NGUYEN
高效率的稀疏后缀排序算法研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    15.0万元
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    农革
  • 依托单位:
大规模动态后缀索引的高效率算法研究
  • 批准号:
    61872391
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    农革
  • 依托单位:
国内基金
海外基金