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NURF复合体亚基BPTF靶向调节肿瘤干细胞特征因子表达在维护结直肠癌TICs干性的作用机制研究

批准号:
82060523
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
34.0 万元
负责人:
詹玮
依托单位:
学科分类:
肿瘤遗传与进化
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
詹玮

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
具有肿瘤干细胞(CSCs)特征的肿瘤起始细胞(TICs)是结直肠癌(CRC)转移和治疗抗性的关键;表观遗传学调节是维持TICs干细胞的重要机制。前期研究发现circRNA募集BPTF与c-Myc基因结合,促进c-Myc表达。BPTF/NURF通过结合到基因的转录调节区域,对CSCs特征性转录因子的表达调节在TICs的CSCs特征维护中可能发挥关键作用,非编码RNA与BPTF的结合可能影响BPTF在特征性基因转录调节区域的募集。本课题假设:“BPTF参与调节其他TICs干性特征转录因子的基因表达,并通过与不同非编码RNA的结合达到靶向基因调节作用”,分析BPTF与结直肠癌TICs中CSCs相关转录调节因子的结合,BPTF对转录因子基因表达的调控作用;筛查与BPTF结合的非编码RNA成分,阐明靶向核小体重塑机制参与CRC中TICs维护机制,为了解CRC进展机制,改善临床诊疗具有重要意义。
英文摘要
umor initiating cells (TICs) with the characteristics of tumor stem cells (CSCs) are the key to colorectal cancer (CRC) metastasis and treatment resistance。 Epigenetic regulation is an important mechanism to maintain the stemness of TICs. Our previous research found that circRNA recruited the binging of BPTF to c-Myc gene therefore promote c-Myc expression and stemness of the cell. BPTF is the core subunit of the nuclear small remodeling factor complex NURF. BPTF / NURF can participate in the regulation of gene expression by binding to the transcriptional regulatory region of genes, in combination with non-coding RNA. BPTF/NURF binding may affect the transcriptional regulation of characteristic genes of stem cell-specific transcription factors, therefore plays a key role in the maintenance of CSCs characteristics of TICs. We hypothesize that "BPTF participates in the regulation of gene expression of other TICs' characteristic transcription factors of stem cells by combining with different non-coding RNAs." In this topic, we will analyze the binding of BPTF to CSCs-related transcriptional regulator genes in colorectal cancer TICs; the effect of BPTF expression changes on the gene expression of these transcription factors; and screen non-coding RNA components that bind to BPTF. The results will help to clarify the mechanism that BPTF/NURF is involved in the maintenance of TICs in CRC. The results of this topic are of great significance for further understanding the mechanism of CRC disease progression and improving clinical diagnosis and treatment.
本项目聚焦于结直肠癌(CRC)的综合性探索,核心目的在于阐明其发病机理、发掘生物标志物及潜在治疗靶点,并建立精准的预后预测模型。.针对hsa_circRNA_102051的调控功能,项目深入分析了GSE147597芯片数据并结合大量临床样本,揭示其在转移性CRC组织及细胞系中的高表达特性,且明确其定位于细胞质。通过细胞及动物模型实验,有力证明了hsa_circRNA_102051在促进CRC细胞增殖、迁移、侵袭及抑制凋亡中的关键作用。在分子机制层面,本研究创新性地发现其作为miR-203a的竞争性内源RNA(ceRNA),调控BPTF表达,并通过Notch信号通路影响细胞干性,为CRC治疗策略的开发提供了潜在的靶点。.在m6A甲基化修饰相关的非编码RNA研究中,项目首先从TCGA数据库中筛选出92例样本数据,鉴定出23个m6A相关基因及一系列相关lncRNAs。通过严格的单因素Cox回归分析,筛选出5个与CRC患者总生存期(OS)显著相关的lncRNAs,构建了具有高效预测能力的风险模型。该模型在多个独立数据集中得到验证,展现出良好的预后预测性能,并揭示了免疫细胞浸润状态(如T细胞亚群)与风险评分之间的紧密联系。此外,结合GO及GSEA富集分析,进一步阐明了这些lncRNAs参与的生物学过程及潜在功能。.关于糖基化基因的研究,项目从TCGA数据库中获取了9635个差异表达基因(DEGs)和242个糖基化相关基因(GRGs),通过交集分析确定了110个候选糖基化基因(CG1)。经过一系列深入分析,最终筛选出5个关键糖蛋白(PGs),构建了预后GRGs模型,并在多组数据中验证了其预测效能。对PGs的功能及调控网络进行探索,揭示了它们之间的协同作用及与CRC临床特征的关联。同时,结合免疫浸润及药物敏感性分析,以及单细胞转录组学的应用,明确了T细胞在CRC肿瘤微环境中的核心作用,为CRC的免疫治疗提供了理论依据。.综上所述,本项目不仅深入探讨了非编码RNA通过调控BPTF影响CRC细胞干性的分子机制,还通过表观遗传学机制构建了CRC的预后及诊断模型,全面解析了CRC发生发展的复杂调控网络。这些研究成果为CRC的早期标志物筛选、分子机制验证及精准治疗策略的开发提供了重要的科学依据和参考方向。
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