关于两亲α-螺旋抗菌肽的柔性、刚度与活性间关系的研究

生物分子的柔性，度量了抗体/抗原（酶/底物）相互作用过程中抗体构象变化的能力，它与其生物活性（尤其是结合亲和力）之间的关系，受到广泛重视。相关研究，不仅有利于深入了解一系列重要的生（病）理过程，并在计算机辅助分子药物设计中具有重要的应用。本项目拟将理论模拟和实验研究相结合，研究（包括含铰链区的）两亲α-螺旋抗菌肽的微观柔性（活性部位构象变化能力）和宏观柔性（分子刚度）与其活性间的关系。这里，我们将采用碱基替换技术、改变两亲α-螺旋抗菌肽的柔性与活性，并测定其活性；同时，通过发展一个用于分析链状蛋白在环境热噪音作用下动态响应的理论模型，结合分子动力学模拟技术，建立一个定量估计多肽链刚度的分析方法；在取得大量实验与分析数据的基础上，力图揭示两亲α-螺旋抗菌肽的微观和宏观柔性与活性间的定量关系，阐释分子的小尺度与大尺度变形能力调控其活性的物理机制，旨在为构效模型的建立，提供一条新的途径。