认识赤潮，进而减小其危害，关键要了解产生赤潮的微藻类型，并且能在自然水体中对其进行分析鉴定。过去传统的赤潮微藻形态分类法以及最近发展的分子分类法都有许多不足之处。为了克服这些方法的缺点，本项目将应用全细胞荧光原位杂交（FISH）技术对赤潮微藻进行定性和定量分析。首先，从主要有害赤潮微藻（主要是甲藻和原甲藻类）的ITS和核糖体大小亚基序列中筛选合适的区域（如D1或D2区域），经PCR扩增后作为FISH 的探针，探索FISH技术分析赤潮藻的最佳实验条件。然后，在室内水体中优选FISH技术用于赤潮微藻定性和定量分析的参数，并将其应用到自然水体中，以期能快速、准确地对微量赤潮藻进行定性和定量分析。本项目的完成将对赤潮早期预报有重要的意义。