本研究拟采用家鸭/番鸭杂交系统，设置正反杂交组合，从基因表达水平和基因组水平上研究杂种优势分子遗传基础。通过mRNA差异显示、抑制性扣除杂交（SSH）、甲基敏感扩增片段多态性（MSAP）以及改进的cDNA-AFLP等分子生物学实验方法，分析家鸭、番鸭及正反半番鸭中mRNA表达、基因组甲基化、线粒体基因表达的差异，并对差异表达基因克隆测定及进一步验证分析，以探讨动物杂种优势的分子遗传机制。