不同基因共享转录工厂的规律性研究

染色体是基因组的存在形式，是遗传和表观遗传信息的共同载体。细胞核是基因组的储存场所，是一种严格分区化的高度不均一组织。转录工厂是核内一种预先存在的、不依赖转录过程的超微结构，是基因转录的主要场所。细胞核中转录工厂的数量有限，需要转录的基因成千甚至上万，不同基因共享同一转录工厂可能是一种普遍现象。本研究拟以胚胎干细胞体外分化发育为模型，通过染色质免疫沉淀与染色体构象俘获、454测序技术的结合,建立一种集研究DNA-DNA、DNA-蛋白相互作用于一体的超高通量筛选技术，进行RNA聚合酶II介导的染色体（基因）相互作用的全基因组超高通量筛选、鉴定及生物信息学分析，抽提出转录过程基因相互作用谱，考察转录工厂共享现象的普遍性；根据基因作用谱、转录谱、组蛋白修饰谱等的比较分析，揭示不同基因共享转录工厂的特异性，探讨转录工厂共享对基因组核内组织结构的可能影响。